More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4043 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3767  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 328 aa  656    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.784386  normal  0.408109 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4043  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 328 aa  656    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04870  cation diffusion facilitator family transporter  65.1 
 
 		 313 aa  393  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  56.66 
 
 		 323 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  35.4 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  33.45 
 
 		 301 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 301 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 301 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 301 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  37.67 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 326 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  34.53 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  31.56 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  35.76 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  35.06 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  37 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 305 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  36.96 
 
 		 302 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  37.45 
 
 		 325 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.53 
 
 		 304 aa  162  9e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  37.82 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  37.82 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  36.24 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  32.86 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  32.31 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  34.57 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  34.19 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  34.57 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  34.06 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  36.03 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  32.99 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  34.53 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  35.48 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  35.19 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  30.95 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  31.11 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  34.42 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  32.45 
 
 		 313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  35.07 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  31.48 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  35.07 
 
 		 313 aa  153  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 317 aa  152  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  31.27 
 
 		 312 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  31.64 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  32.57 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  37.69 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  30.86 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  31.37 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  32.4 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  33.58 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  33.65 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  35.51 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  32.21 
 
 		 299 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  32.58 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  28.62 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0726  cation efflux protein  37.33 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.951048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  30.03 
 
 		 340 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  29.19 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  29.14 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  34.21 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  30.88 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.21 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  29.67 
 
 		 352 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  30.8 
 
 		 327 aa  142  9e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  36.47 
 
 		 304 aa  142  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  34.48 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  26.74 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  34.8 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0495  cation diffusion facilitator family transporter  31.31 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0506  cation diffusion facilitator family transporter  31.31 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  31.27 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  32.87 
 
 		 299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0517  cation diffusion facilitator family transporter  31.31 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  33.71 
 
 		 305 aa  139  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0715  cation diffusion facilitator family transporter  27.5 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000468009  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  29.12 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  30.61 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  30.61 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  33.86 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0673  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  32.61 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  29.37 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  29.72 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  32.47 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  32.2 
 
 		 305 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  29.37 
 
 		 299 aa  135  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  31.06 
 
 		 325 aa  135  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  31.06 
 
 		 325 aa  135  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.04 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  30.26 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  31.29 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  34.02 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>