More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04870 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_04870  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
313 aa  618  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4043  cation diffusion facilitator family transporter  65.1 
 
 
328 aa  393  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3767  cation diffusion facilitator family transporter  65.1 
 
 
328 aa  393  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.784386  normal  0.408109 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  57.14 
 
 
323 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  36.77 
 
 
305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  34.93 
 
 
299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  35.42 
 
 
301 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  35.42 
 
 
301 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.42 
 
 
301 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.42 
 
 
301 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  31.6 
 
 
334 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  35.9 
 
 
299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  32.76 
 
 
326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  30.8 
 
 
326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  33.7 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  31.84 
 
 
298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  32.44 
 
 
305 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  32.44 
 
 
305 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  35.61 
 
 
310 aa  162  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.47 
 
 
304 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  32.18 
 
 
331 aa  162  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  38.13 
 
 
307 aa  159  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  31.71 
 
 
298 aa  159  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  35.23 
 
 
307 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  36.82 
 
 
302 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  33.84 
 
 
305 aa  156  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  33.45 
 
 
316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  32.61 
 
 
309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  36 
 
 
327 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 
315 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  38.85 
 
 
309 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  31.58 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  35.46 
 
 
313 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 
312 aa  153  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  35.54 
 
 
299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  31.37 
 
 
309 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  35.98 
 
 
305 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  31.58 
 
 
299 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  31.23 
 
 
299 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  31.27 
 
 
309 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  33.01 
 
 
314 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  31.8 
 
 
299 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  31.16 
 
 
316 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  35.35 
 
 
299 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  29.92 
 
 
342 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  30.97 
 
 
327 aa  149  8e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  32.16 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  27.72 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  31.14 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  28.48 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  35.14 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  28.3 
 
 
312 aa  146  3e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  35.14 
 
 
325 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 
319 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.42 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  31.5 
 
 
311 aa  146  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  29.73 
 
 
306 aa  146  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.42 
 
 
299 aa  146  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  31.42 
 
 
295 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  37.69 
 
 
304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  29.07 
 
 
294 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  31.14 
 
 
315 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  31.42 
 
 
299 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  31.42 
 
 
299 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  37.15 
 
 
305 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  30.32 
 
 
352 aa  142  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.84 
 
 
297 aa  142  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.18 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1433  cation diffusion facilitator family transporter  29.07 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  31.18 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  31.43 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 
339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  30.48 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  26.72 
 
 
314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.84 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  30.58 
 
 
336 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  31.8 
 
 
311 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  28.25 
 
 
317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  33.81 
 
 
320 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  36.3 
 
 
307 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  28.12 
 
 
314 aa  138  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  26.95 
 
 
298 aa  138  1e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  34.8 
 
 
303 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  30.8 
 
 
333 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0452  cation diffusion facilitator family transporter  32.17 
 
 
309 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0402588  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  35.08 
 
 
300 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  27.64 
 
 
284 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  32.32 
 
 
316 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  31.99 
 
 
325 aa  135  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  32.58 
 
 
308 aa  135  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  29.72 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  32.41 
 
 
298 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  29.72 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  29.72 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>