290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3361 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  100 
 
 		 516 aa  994    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  54.41 
 
 		 522 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  48.96 
 
 		 282 aa  180  7e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  56.57 
 
 		 281 aa  179  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  55.11 
 
 		 282 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  54.59 
 
 		 281 aa  173  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  53.41 
 
 		 292 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  46.8 
 
 		 281 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  46.8 
 
 		 281 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  45.69 
 
 		 302 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  44 
 
 		 302 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  45.93 
 
 		 284 aa  134  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  42.49 
 
 		 303 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  42.42 
 
 		 395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  42.86 
 
 		 395 aa  130  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  40.11 
 
 		 303 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  42.26 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  44.23 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  41.18 
 
 		 301 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  40.36 
 
 		 321 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  43.59 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  39.88 
 
 		 320 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  43.59 
 
 		 302 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  39.53 
 
 		 320 aa  118  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  42.35 
 
 		 311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  41.87 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  38.37 
 
 		 320 aa  113  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  38.69 
 
 		 320 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  36.63 
 
 		 320 aa  111  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  38.6 
 
 		 274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  41.24 
 
 		 293 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  40.58 
 
 		 274 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  37.14 
 
 		 592 aa  106  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  38.58 
 
 		 273 aa  106  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  37.88 
 
 		 273 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  41.92 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2876  flagellin-like  35 
 
 		 282 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  39.09 
 
 		 273 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  37.93 
 
 		 275 aa  105  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  38.65 
 
 		 585 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2814  flagellin domain protein  35.05 
 
 		 332 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  38.24 
 
 		 327 aa  103  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  36.02 
 
 		 279 aa  103  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  38.46 
 
 		 272 aa  103  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  38.27 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2555  flagellin domain protein  35.15 
 
 		 332 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  38.85 
 
 		 277 aa  98.2  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  41.79 
 
 		 380 aa  96.3  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  50.5 
 
 		 389 aa  95.9  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  41.18 
 
 		 282 aa  94.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  41.18 
 
 		 269 aa  94.4  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  31.33 
 
 		 321 aa  94.4  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  31.8 
 
 		 590 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  37.42 
 
 		 292 aa  92.8  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  33.53 
 
 		 277 aa  92  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  34.95 
 
 		 328 aa  90.9  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0331  flagellin domain protein  33.56 
 
 		 320 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  53.57 
 
 		 364 aa  89  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0363  flagellin domain protein  32.21 
 
 		 320 aa  86.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0920574  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  46.15 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  42.11 
 
 		 389 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  29.63 
 
 		 582 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  43.68 
 
 		 494 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  24.86 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  49.33 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  25.05 
 
 		 497 aa  73.6  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  35.56 
 
 		 327 aa  72.8  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3219  flagella associated protein  33.33 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  41.57 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  41.24 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0108  flagellin domain-containing protein  28.47 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  31.43 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  33.11 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0670  flagellin domain protein  29.73 
 
 		 780 aa  62  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  31.76 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  31.08 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  32.39 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  37.61 
 
 		 630 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  43.06 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  43.24 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  36 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  27.86 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  29.01 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  34.31 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0803  flagellin domain protein  27.34 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  35.35 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  33.01 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  33.01 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  34.34 
 
 		 492 aa  57  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  32.32 
 
 		 405 aa  57  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  30.71 
 
 		 272 aa  56.6  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3159  putative flagellin  33.98 
 
 		 274 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00882995  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  32.67 
 
 		 375 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1476  flagellin domain-containing protein  29.55 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1811  flagellin domain-containing protein  28.57 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.340499  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  35 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  36 
 
 		 387 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 		 494 aa  55.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  31.62 
 
 		 609 aa  55.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  29.55 
 
 		 387 aa  55.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>