More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2837 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2837  aminotransferase  100 
 
 		 286 aa  584  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0197533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2216  aminotransferase  76.22 
 
 		 287 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0891  aminotransferase  76.14 
 
 		 287 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.413724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2277  aminotransferase  74.74 
 
 		 287 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3729  aminotransferase  69.12 
 
 		 287 aa  418  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0868  aminotransferase  63.96 
 
 		 287 aa  391  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896873 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3773  aminotransferase  59.21 
 
 		 284 aa  332  5e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.783601  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0626  aminotransferase  58.12 
 
 		 284 aa  328  8e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0300  aminotransferase  56.34 
 
 		 284 aa  322  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0585  aminotransferase  53.6 
 
 		 293 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1251  aminotransferase  55 
 
 		 293 aa  297  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1102  aminotransferase  51.99 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1805  aminotransferase  53.6 
 
 		 285 aa  290  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5063  aminotransferase  54.15 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239905  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4602  aminotransferase  53.79 
 
 		 288 aa  287  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.042075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0951  aminotransferase  52.17 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0832  aminotransferase  50.52 
 
 		 295 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0999  aminotransferase  48.74 
 
 		 290 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.471878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5073  aminotransferase  49.1 
 
 		 307 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.068349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5485  aminotransferase  51.62 
 
 		 288 aa  275  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.787347  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6433  aminotransferase  46.91 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0508  aminotransferase  44.13 
 
 		 294 aa  228  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  31.67 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  29.41 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  29.04 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  32.95 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  31.83 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  31.09 
 
 		 292 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  28.47 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  30.74 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  30.74 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  30.74 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  30.74 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  30.74 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  31.08 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  30.74 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  30.74 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  31.08 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  31.08 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  31.08 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  31.34 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2786  branched-chain amino acid aminotransferase  30.15 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  28.31 
 
 		 287 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  30.74 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  30.41 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  30.41 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  30.74 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  29.5 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  30.22 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3301  branched-chain amino acid aminotransferase  31.84 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  30.39 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  30.24 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  30.51 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  28.1 
 
 		 286 aa  103  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2801  branched-chain amino acid aminotransferase  29.77 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1140  branched-chain amino acid aminotransferase  29.77 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.817897  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  32.74 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  30.6 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  28.27 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  31.01 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  31.07 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7270  branched-chain amino acid aminotransferase  31.62 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  30.68 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  30.6 
 
 		 308 aa  99.4  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  30.34 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  29.39 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  29.12 
 
 		 299 aa  99  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  30.71 
 
 		 308 aa  99  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  28.06 
 
 		 303 aa  99  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6017  branched-chain amino acid aminotransferase  30.88 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299425 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  28.42 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  28.42 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  28.42 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  28.42 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  28.42 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  31.05 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  28.42 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  30.29 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  28.42 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  32.12 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  29.93 
 
 		 304 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  31.75 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  30.77 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  29.3 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  28.42 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  29.47 
 
 		 311 aa  96.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  29.2 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  29.2 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  29.2 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  29.2 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  29.2 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  28.83 
 
 		 312 aa  96.3  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  30.26 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  29.35 
 
 		 297 aa  95.9  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>