More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2395 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2395  transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  300  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0652  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 151 aa  200  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.22955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1239  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 151 aa  196  9e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677106 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1866  AsnC family transcriptional regulator  66 
 
 		 151 aa  195  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0515  AsnC family transcriptional regulator  65.33 
 
 		 151 aa  194  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.900323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1759  AsnC family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0120773  normal  0.159255 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2302  AsnC family transcriptional regulator  57.33 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  32.45 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1867  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0516  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.904906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0653  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 152 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal  0.222983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.09 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.24 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6537  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.201415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1240  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 151 aa  98.2  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1758  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  96.7  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00375085  normal  0.163096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  30.92 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  31.33 
 
 		 157 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  36.88 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 180 aa  92  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 164 aa  91.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2859  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2301  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 152 aa  91.3  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 160 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 159 aa  88.6  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  29.8 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 165 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 157 aa  88.2  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 172 aa  88.6  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 151 aa  87  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 162 aa  87.4  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1694  transcriptional regulator, AsnC family  32.67 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.849273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2001  transcriptional regulator, AsnC family  32.67 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 198 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 154 aa  85.5  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 198 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 169 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1442  transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 282 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1179  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  84.7  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.876809  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1780  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  84.7  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152537  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2096  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 162 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 161 aa  84  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  84.3  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 198 aa  84  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0727  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 156 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  32.45 
 
 		 169 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1207  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 156 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1180  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 156 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 169 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  38.28 
 
 		 166 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 165 aa  84  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2413  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 157 aa  83.6  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0915  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>