287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0969 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2907  mannitol dehydrogenase-like  70.76 
 
 		 499 aa  664    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  68.17 
 
 		 492 aa  664    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0969  mannitol dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 499 aa  1018    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.124507 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1732  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  55.79 
 
 		 477 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0096  mannitol dehydrogenase  55.6 
 
 		 477 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.027752  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3848  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  50.31 
 
 		 494 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.611991  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1685  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  54.8 
 
 		 477 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  50.41 
 
 		 659 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  47.85 
 
 		 495 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2459  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  49.68 
 
 		 589 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4177  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  50.1 
 
 		 487 aa  439  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  49.47 
 
 		 494 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3446  Mannitol dehydrogenase domain  47.64 
 
 		 493 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  47.95 
 
 		 493 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  46.64 
 
 		 497 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  45.68 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.31 
 
 		 494 aa  363  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.31 
 
 		 505 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.7 
 
 		 492 aa  354  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  40.76 
 
 		 484 aa  352  5.9999999999999994e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.43 
 
 		 506 aa  348  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  39.05 
 
 		 500 aa  347  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  41.39 
 
 		 491 aa  347  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  39.71 
 
 		 492 aa  347  4e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  46.28 
 
 		 491 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  43.68 
 
 		 497 aa  343  4e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  41.46 
 
 		 499 aa  341  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.1 
 
 		 488 aa  336  7e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.7 
 
 		 491 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.61 
 
 		 528 aa  334  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  41.15 
 
 		 503 aa  334  3e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  44.06 
 
 		 491 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  40.04 
 
 		 472 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.04 
 
 		 472 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0634883 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  37.65 
 
 		 502 aa  326  6e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  42.14 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.83 
 
 		 472 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  42.66 
 
 		 490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.14 
 
 		 486 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  40.25 
 
 		 520 aa  312  9e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  41.07 
 
 		 497 aa  311  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  40.93 
 
 		 493 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.88 
 
 		 505 aa  307  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  39.09 
 
 		 486 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  42.17 
 
 		 496 aa  306  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5663  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.42 
 
 		 509 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733675 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  39.09 
 
 		 486 aa  306  8.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  39.09 
 
 		 486 aa  305  9.000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  39.09 
 
 		 486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3727  mannitol dehydrogenase Rossman-like  43.42 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4641  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.42 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.88 
 
 		 486 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  38.67 
 
 		 486 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  38.67 
 
 		 486 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  38.88 
 
 		 486 aa  302  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  40.87 
 
 		 493 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  41.37 
 
 		 489 aa  299  9e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  43.44 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  43.2 
 
 		 464 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.27 
 
 		 493 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  40.68 
 
 		 458 aa  296  5e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  39.86 
 
 		 490 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  39.86 
 
 		 490 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  39.64 
 
 		 490 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  42.48 
 
 		 459 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  39.64 
 
 		 490 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  39.64 
 
 		 490 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  40.76 
 
 		 492 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  37.88 
 
 		 493 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  39.66 
 
 		 478 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  39.02 
 
 		 490 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  37.91 
 
 		 488 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.2 
 
 		 509 aa  281  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  41.45 
 
 		 486 aa  280  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3090  Mannitol dehydrogenase domain  39.28 
 
 		 506 aa  279  9e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  40.28 
 
 		 498 aa  278  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  38.33 
 
 		 488 aa  277  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  41.2 
 
 		 486 aa  277  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  34.7 
 
 		 487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  37.86 
 
 		 488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.72 
 
 		 486 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  40.72 
 
 		 486 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  40.96 
 
 		 486 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.23 
 
 		 483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  36.15 
 
 		 488 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  38.49 
 
 		 486 aa  272  8.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  37.04 
 
 		 488 aa  272  9e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.04 
 
 		 488 aa  272  9e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  37.04 
 
 		 488 aa  272  9e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  40.72 
 
 		 486 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  37.91 
 
 		 488 aa  272  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.91 
 
 		 488 aa  272  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  40.72 
 
 		 486 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  40.72 
 
 		 486 aa  272  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.38 
 
 		 493 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.64 
 
 		 497 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.69 
 
 		 485 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  37.97 
 
 		 488 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.48 
 
 		 486 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  37.97 
 
 		 488 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>