More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1438 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  100 
 
 		 118 aa  239  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  45.45 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  43.1 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  43.93 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  42.86 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 120 aa  90.1  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  40 
 
 		 327 aa  89.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 331 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 331 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 331 aa  88.6  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 331 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 331 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 331 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  39.66 
 
 		 331 aa  88.2  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2684  response regulator receiver domain-containing protein  39.47 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 331 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 331 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 331 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.66 
 
 		 331 aa  88.2  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  40.83 
 
 		 334 aa  88.2  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.18 
 
 		 331 aa  87.8  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  39.29 
 
 		 331 aa  87.4  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0087  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.38 
 
 		 335 aa  87  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 122 aa  87  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 119 aa  86.7  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 122 aa  87  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  40.83 
 
 		 334 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.18 
 
 		 331 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 123 aa  84.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  41.07 
 
 		 334 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  41.9 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.93 
 
 		 331 aa  84  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  40.2 
 
 		 321 aa  83.6  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3857  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  40.95 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  40.95 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  83.6  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  40.95 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3314  response regulator receiver protein  36.7 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  35.4 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  36.75 
 
 		 376 aa  81.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  40.95 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  40.95 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0386  response regulator receiver domain-containing protein  39.6 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  39.17 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  40.18 
 
 		 334 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 811 aa  80.1  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  41.82 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  40.91 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  40.91 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  40.91 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  40.91 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  40.91 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  40.91 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  40.91 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.21 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0913  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 544 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  41.44 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2939  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  38.1 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  35.71 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1448  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.637441  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.79 
 
 		 229 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  40.59 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>