More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3164 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3164  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
153 aa  317  5e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000152155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4179  protein tyrosine phosphatase  54.97 
 
 
156 aa  164  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000868477  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2149  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
157 aa  155  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0069  protein tyrosine phosphatase  45.95 
 
 
154 aa  140  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326824  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  48.03 
 
 
153 aa  138  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  47.33 
 
 
322 aa  135  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  46.36 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  50.34 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  46.31 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4829  protein tyrosine phosphatase  45.45 
 
 
148 aa  120  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00563012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2596  protein tyrosine phosphatase  40.51 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.108724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2770  protein tyrosine phosphatase  42.21 
 
 
173 aa  114  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0258  protein tyrosine phosphatase  42.58 
 
 
168 aa  114  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000607836  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  43.62 
 
 
146 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.95 
 
 
146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  42.28 
 
 
146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  43.62 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  43.62 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  43.62 
 
 
146 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0808  protein tyrosine phosphatase  43.75 
 
 
147 aa  112  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  43.62 
 
 
146 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 
146 aa  110  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2393  protein tyrosine phosphatase  55.96 
 
 
228 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0736757 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 
146 aa  107  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  41.22 
 
 
146 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  39.86 
 
 
146 aa  104  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4430  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
148 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332245  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2592  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.58 
 
 
383 aa  100  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1019  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  44.72 
 
 
145 aa  100  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.523657  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2515  protein tyrosine phosphatase  36.49 
 
 
184 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0845439  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4026  protein tyrosine phosphatase  35.53 
 
 
163 aa  98.2  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4431  protein tyrosine phosphatase  39.19 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1697  protein tyrosine phosphatase  37.16 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.718812  hitchhiker  0.00000825207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5117  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 
145 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0199458 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5906  protein tyrosine phosphatase  40.3 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305161  normal  0.183123 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4276  tyrosine phosphatase  38 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4410  protein tyrosine phosphatase  38.51 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1930  protein tyrosine phosphatase  39.47 
 
 
165 aa  95.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0798  protein tyrosine phosphatase  35.81 
 
 
150 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3746  protein tyrosine phosphatase  35.81 
 
 
151 aa  94  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.224825  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6174  protein tyrosine phosphatase  40.3 
 
 
144 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1353  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  40.54 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2256  putative protein tyrosine phosphatase  42.5 
 
 
145 aa  90.5  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1721  phosphotyrosine protein phosphatase  34.75 
 
 
139 aa  90.1  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.21053  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6746  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406991  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7399  protein tyrosine phosphatase  36.57 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2865  protein tyrosine phosphatase  39.68 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5369  protein tyrosine phosphatase  34.21 
 
 
162 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0252  protein tyrosine phosphatase  33.79 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.796574  hitchhiker  0.00298229 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0648  protein tyrosine phosphatase  32.64 
 
 
143 aa  87  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.396254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1137  protein tyrosine phosphatase  35.14 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00271844  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3259  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.51 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0610  protein tyrosine phosphatase  33.79 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24726 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2861  protein tyrosine phosphatase  34.52 
 
 
183 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211952 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1087  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000390207  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2274  protein tyrosine phosphatase  33.78 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796116  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2151  protein tyrosine phosphatase  38.78 
 
 
139 aa  84.3  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2189  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.78 
 
 
139 aa  84.3  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6021  protein tyrosine phosphatase  38.66 
 
 
145 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.562342  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1941  protein tyrosine phosphatase  40.98 
 
 
144 aa  84  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3442  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.33 
 
 
155 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759017  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4541  protein tyrosine phosphatase  33.78 
 
 
147 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415134  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3702  protein tyrosine phosphatase  33.78 
 
 
147 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3822  protein tyrosine phosphatase  33.78 
 
 
147 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3273  protein-tyrosine-phosphatase  38.51 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4917  protein tyrosine phosphatase  33.78 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.2258  hitchhiker  0.000710684 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6262  protein tyrosine phosphatase  31.08 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.70235  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3221  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.84 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4085  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.68 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0397247  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3845  protein tyrosine phosphatase  34 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1703  protein tyrosine phosphatase  35.46 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368639  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2621  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.43 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3195  protein tyrosine phosphatase  37.1 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3277  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.248393  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0916  hypothetical protein  32.43 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462003  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4054  protein tyrosine phosphatase  36.15 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2483  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.43 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0620  protein tyrosine phosphatase  34.09 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0796312  normal  0.256744 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0545  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase wzb  31.76 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5850  protein tyrosine phosphatase  37.21 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0579  phosphotyrosine protein phosphatase  33.33 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0795489  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3224  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.72 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.067627  normal  0.207784 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2716  phosphotyrosine-protein phosphatase  37.69 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0445008  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0826  protein tyrosine phosphatase  38.81 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0965  protein tyrosine phosphatase  32.48 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151413  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4094  hypothetical protein  35.94 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0414823 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0508  protein tyrosine phosphatase  35.38 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2866  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  35.66 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.52 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3035  protein tyrosine phosphatase  32 
 
 
144 aa  77  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1297  protein tyrosine phosphatase  32 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4757  protein tyrosine phosphatase  31.9 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.347333  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2393  protein tyrosine phosphatase  33.83 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.619492  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  33.77 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3693  protein tyrosine phosphatase  34.62 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566781  normal  0.81094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1190  protein tyrosine phosphatase  37.19 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2192  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.08 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5548  protein tyrosine phosphatase  33.78 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3725  protein tyrosine phosphatase  33.78 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.353108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>