244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2398 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2398  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 		 128 aa  254  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0698  surface presentation of antigens (SPOA) protein  41.27 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.137334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1755  surface presentation of antigens (SPOA) protein  40.65 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0784  flagellar motor switch FliN  32.2 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0020352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  39.02 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  39.02 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  39.02 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  31.15 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.94 
 
 		 357 aa  68.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  33.64 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0855  flagellar motor switch protein FliN  31.91 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.172432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  32.11 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  31.82 
 
 		 126 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2762  flagellar motor switch protein FliY  32.67 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  32.63 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  40.51 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  38.1 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  37.89 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  38.1 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  32.23 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3910  flagellar motor switch protein FliN  39.47 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  39.74 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  37.18 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  38.55 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3826  flagellar motor switch protein FliN  39.47 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2035  surface presentation of antigens (SPOA) protein  30.84 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.853353  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  38.37 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  38.37 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  38.55 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  38.04 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  38.55 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  37.66 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  29.25 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  28.91 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  37.84 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  32.35 
 
 		 381 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  37.84 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  37.84 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  37.84 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  36.9 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  37.84 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  32.29 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  34 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1121  flagellar motor switch protein FliN  34.44 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.5679 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  37.84 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  36.9 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  37.84 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  37.84 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  37.84 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  37.35 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  34.94 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  36.9 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  37.84 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  34.94 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  37.84 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  37.84 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  36.9 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  36.9 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  36.9 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  38.46 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  36.9 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  37.84 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  37.84 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  37.18 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  34 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  36.9 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  34.48 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  37.18 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  32.26 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  36.25 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  37.04 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  32.26 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  37.04 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  36.36 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  32.26 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  37.04 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  36.36 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  37.18 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  35.9 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  38.75 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  37.04 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  37.04 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  37.04 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  37.04 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  36.36 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  37.04 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  37.04 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  37.04 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  34.34 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  38.75 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  34.34 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  34.34 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  34.34 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  34.34 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  38.75 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1649  flagellar motor switch protein FliN  32.58 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211247  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  35.9 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  37.35 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  37.5 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  37.5 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>