More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1715 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 292 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  58.7 
 
 		 294 aa  362  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  50.34 
 
 		 292 aa  292  5e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  49.67 
 
 		 296 aa  291  8e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  51.37 
 
 		 290 aa  290  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  48.28 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  49.28 
 
 		 293 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  46.74 
 
 		 294 aa  269  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  47.46 
 
 		 293 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  47.12 
 
 		 293 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.59 
 
 		 291 aa  266  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  47.12 
 
 		 293 aa  263  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  46.78 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  46.78 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  46.78 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  46.78 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  46.78 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  46.78 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  46.78 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  46.78 
 
 		 293 aa  258  8e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  46.44 
 
 		 293 aa  257  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  46.44 
 
 		 293 aa  257  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  46.38 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.2 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  46.01 
 
 		 287 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.47 
 
 		 306 aa  245  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.05 
 
 		 319 aa  238  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.18 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.37 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.45 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.2 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.32 
 
 		 319 aa  229  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.1 
 
 		 300 aa  229  6e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.89 
 
 		 300 aa  228  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.75 
 
 		 290 aa  228  8e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.81 
 
 		 295 aa  226  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.81 
 
 		 293 aa  226  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.77 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.48 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  42.47 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.8 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  40.46 
 
 		 307 aa  218  8.999999999999998e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  41.75 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.28 
 
 		 375 aa  211  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  40.47 
 
 		 376 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  39.87 
 
 		 405 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  37.79 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.57 
 
 		 288 aa  202  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  36.57 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  38.89 
 
 		 380 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  40.6 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.95 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  40.07 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  36.21 
 
 		 325 aa  195  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.01 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  38.11 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  41.48 
 
 		 370 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  39.46 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  39.46 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  43.17 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1753  ribosome-associated GTPase  39.78 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  38.36 
 
 		 343 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  41.64 
 
 		 364 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  37.29 
 
 		 343 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  36.36 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.91 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  37.29 
 
 		 354 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  37.29 
 
 		 354 aa  186  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.51 
 
 		 316 aa  186  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  37.29 
 
 		 354 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  37.29 
 
 		 354 aa  186  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  38.7 
 
 		 343 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5830  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.08 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.700319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  38.36 
 
 		 343 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  38.36 
 
 		 343 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  34.88 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.25 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  35.97 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  36.21 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16978  predicted protein  41.09 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  34.98 
 
 		 354 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  35.67 
 
 		 315 aa  178  8e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  38.89 
 
 		 343 aa  178  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  35.08 
 
 		 354 aa  178  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  34.65 
 
 		 340 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  37.78 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  36.64 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  34.65 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  36.84 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  34.65 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  37.78 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf718  GTPase YjeQ/EngC  35.4 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  36.51 
 
 		 353 aa  176  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2727  ribosome-associated GTPase  34.22 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.853912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  36.55 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1078  ribosome-associated GTPase  38.34 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  32.27 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  36.18 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0099  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.6 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  36.63 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>