More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2864 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
257 aa  530  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.28043  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0650  putative crotonase  42.74 
 
 
252 aa  208  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 
259 aa  142  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
258 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
257 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.69 
 
 
256 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  35.92 
 
 
257 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.37 
 
 
254 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.24 
 
 
253 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 
257 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
259 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.13 
 
 
257 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.1 
 
 
260 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  35.56 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  36.48 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.85 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 
259 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
259 aa  133  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.07 
 
 
260 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1548  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.89 
 
 
248 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
257 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
257 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  34.02 
 
 
258 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
257 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
257 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.88 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  35.1 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
259 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
258 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  33.88 
 
 
262 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  34.16 
 
 
257 aa  129  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.06 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  34.16 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
259 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  32.77 
 
 
258 aa  128  8.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.24 
 
 
259 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  32.91 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.56 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.66 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.07 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.52 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  33.88 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.77 
 
 
260 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 
257 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
257 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.69 
 
 
259 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 
257 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.67 
 
 
257 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.01 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.97 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
261 aa  125  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 
258 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 
257 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 
257 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.13 
 
 
259 aa  125  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
277 aa  125  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
260 aa  125  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.75 
 
 
259 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.13 
 
 
259 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.38 
 
 
257 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 
270 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.45 
 
 
260 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.45 
 
 
260 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.79 
 
 
260 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.43 
 
 
258 aa  125  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 
258 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 
258 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  35.78 
 
 
270 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.13 
 
 
258 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 
261 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
257 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 
259 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.05 
 
 
260 aa  123  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  34.69 
 
 
258 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.13 
 
 
659 aa  123  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0166  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.17 
 
 
249 aa  123  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0774  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 
254 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.730514  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
258 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
257 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.54 
 
 
257 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
260 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  34.69 
 
 
258 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>