99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1964 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  100 
 
 		 352 aa  730    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  51.18 
 
 		 361 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  36.67 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  31.96 
 
 		 391 aa  156  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  30.56 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  29.37 
 
 		 414 aa  142  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  29.35 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  29.95 
 
 		 406 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  30.52 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  27.4 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  29.26 
 
 		 425 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  28.1 
 
 		 396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  27.95 
 
 		 421 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  27.92 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  24.1 
 
 		 414 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  24.63 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  24.08 
 
 		 411 aa  87  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  25.22 
 
 		 401 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  21.97 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  23.61 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  21.5 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  23.8 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  25.5 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  23.69 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  24.29 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  22.47 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  24.18 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  23.15 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  24.75 
 
 		 433 aa  57  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  22.8 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  22.16 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  24.88 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  21.01 
 
 		 413 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  21.59 
 
 		 411 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  21.31 
 
 		 415 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  20.96 
 
 		 408 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  23.32 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  25.5 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  22.13 
 
 		 431 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  20.77 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  26.75 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  28.81 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  24.57 
 
 		 407 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  22.06 
 
 		 413 aa  53.5  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  22.66 
 
 		 410 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  31.75 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  22.67 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  21.79 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  22.65 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  20.73 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  23.81 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  21.18 
 
 		 411 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  22.97 
 
 		 407 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  22.97 
 
 		 407 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  26.06 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  25.17 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  23.26 
 
 		 410 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  21.68 
 
 		 406 aa  50.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  22.22 
 
 		 407 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  23.76 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  21.99 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  24.79 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  22.03 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  50 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  25.74 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  28.97 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  24 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  25.15 
 
 		 248 aa  47.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  25.74 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  21.32 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 358 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  20.9 
 
 		 444 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5454  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 317 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.80361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  32 
 
 		 457 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  21.79 
 
 		 407 aa  46.6  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1487  hypothetical protein  23.49 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  34.02 
 
 		 298 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 346 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  28.72 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  21.97 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  25.81 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3380  Methyltransferase type 12  31.19 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  20.98 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  28.99 
 
 		 306 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  21.53 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  25.17 
 
 		 2112 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  25.31 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  28.57 
 
 		 215 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.46 
 
 		 229 aa  43.5  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.13 
 
 		 232 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 324 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  28.87 
 
 		 488 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  25.58 
 
 		 306 aa  43.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 293 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1402  Methyltransferase type 11  26.94 
 
 		 394 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  24.86 
 
 		 240 aa  42.7  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  20.93 
 
 		 419 aa  42.7  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>