284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0198 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0198  cytochrome b/b6 domain-containing protein  100 
 
 		 251 aa  510  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2119  cytochrome b/b6-like  55.27 
 
 		 247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.940192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4252  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.77 
 
 		 562 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000252204  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1459  cytochrome b/b6 domain protein  43.04 
 
 		 451 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1554  Cytochrome b/b6 domain protein  43.04 
 
 		 451 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2404  cytochrome b/b6-like  43.04 
 
 		 451 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0242  cytochrome b/b6 domain-containing protein  43.48 
 
 		 448 aa  178  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4024  cytochrome b/b6 domain protein  40.95 
 
 		 206 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2932  cytochrome b/b6  42.38 
 
 		 206 aa  163  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2130  cytochrome b6  36.95 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000123643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2251  cytochrome b6  38.71 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00036602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0489  cytochrome b6  36.95 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4115  Cytochrome b/b6 domain protein  40 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03511  cytochrome b6  39.63 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03491  cytochrome b6  39.63 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21851  cytochrome b6  39.63 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03571  cytochrome b6  39.63 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.223543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3766  cytochrome b6  37.35 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1650  cytochrome b6  37.35 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1433  cytochrome b6  37.35 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1405  cytochrome b6  37.35 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1405  cytochrome b6  37.35 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00694033  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03611  cytochrome b6  40.09 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1686  cytochrome b6  37.35 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1545  cytochrome b6  37.35 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0331  cytochrome b6  39.63 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1617  cytochrome b6  37.35 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11169 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1247  cytochrome b6  37.35 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.363884  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1137  cytochrome b6  40.09 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720211 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1579  cytochrome b6  37.35 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1448  cytochrome b6  37.35 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227629  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3538  cytochrome b6  38.25 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2576  cytochrome b6  38.25 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1702  cytochrome b6  39.17 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04171  cytochrome b6  39.17 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.576344 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2331  cytochrome b6  39.17 
 
 		 215 aa  159  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.520251 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1849  cytochrome b6  39.17 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2347  cytochrome b6  38.25 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0485  cytochrome b6  39.17 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.153664  normal  0.560509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3441  cytochrome b6  39.17 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00977243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1703  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.62 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0647  Cytochrome b/b6 domain protein  41.46 
 
 		 269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.334233  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0458  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.53 
 
 		 206 aa  151  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5927  Cytochrome b/b6 domain protein  40.31 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3893  Cytochrome b/b6 domain protein  37.82 
 
 		 575 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290413  normal  0.541896 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0206  Cytochrome b/b6 domain protein  44.39 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0578  Cytochrome b/b6 domain protein  38.92 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.101746  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3544  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.19 
 
 		 488 aa  143  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.148449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2711  cytochrome b/b6-like protein  36.56 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2957  cytochrome b/b6-like protein  37 
 
 		 257 aa  141  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3097  Cytochrome b/b6 domain protein  35.96 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1196  Cytochrome b/b6 domain  39.05 
 
 		 206 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0539  cytochrome b/b6-like  43.33 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1923  cytochrome b/b6-like  38.27 
 
 		 367 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.08033  normal  0.565515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2380  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.22 
 
 		 367 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00314618  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1986  Cytochrome b/b6 domain  36.92 
 
 		 431 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.282251  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1779  Cytochrome b/b6 domain  34.22 
 
 		 422 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.484297  decreased coverage  0.00239788 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0467  Cytochrome b/b6 domain  41.67 
 
 		 421 aa  131  9e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  37.77 
 
 		 464 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3174  Cytochrome b/b6 domain protein  37.76 
 
 		 367 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  35.64 
 
 		 426 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0430  cytochrome b/b6 domain-containing protein  41.04 
 
 		 431 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00372181  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2108  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.7 
 
 		 410 aa  125  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0919786  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  34.01 
 
 		 410 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0395  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  37.23 
 
 		 426 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.488441  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1649  cytochrome b/b6  38.78 
 
 		 367 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  34.04 
 
 		 469 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  31.06 
 
 		 466 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  35.53 
 
 		 403 aa  121  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0362  Cytochrome b/b6 domain  43.51 
 
 		 429 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000296669  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1087  cytochrome b/b6 domain protein  37.24 
 
 		 367 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1333  Cytochrome b/b6 domain protein  35.82 
 
 		 488 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.706322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.02 
 
 		 470 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5502  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.18 
 
 		 471 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189406 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  33.49 
 
 		 410 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1718  cytochrome b-c complex, cytochrome b subunit  42.75 
 
 		 429 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000282994  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  35.05 
 
 		 416 aa  119  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  34.01 
 
 		 403 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  35.05 
 
 		 416 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  35.64 
 
 		 403 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  32.99 
 
 		 414 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  30.64 
 
 		 466 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.65 
 
 		 403 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  35.05 
 
 		 416 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.01 
 
 		 404 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  33.5 
 
 		 404 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.01 
 
 		 404 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0022  Cytochrome b/b6 domain protein  32.84 
 
 		 472 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401541  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0931  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.43 
 
 		 467 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4439  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  34.04 
 
 		 423 aa  115  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0243  Cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.36 
 
 		 429 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3695  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.86 
 
 		 472 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.721065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  32.49 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  32.14 
 
 		 747 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  32.14 
 
 		 410 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  32.49 
 
 		 403 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  31.98 
 
 		 403 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0753  Cytochrome b/b6 domain protein  34.86 
 
 		 473 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  33.16 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  30.61 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>