More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_136 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  285  2e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  87.68 
 
 		 138 aa  239  7e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  83.94 
 
 		 138 aa  237  5e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  59.23 
 
 		 132 aa  171  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  58.4 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  59.23 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  57.14 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  55.12 
 
 		 132 aa  157  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  55.91 
 
 		 132 aa  156  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  52 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  50.78 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  51.97 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  52.34 
 
 		 132 aa  147  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  54.03 
 
 		 133 aa  146  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  51.91 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  54.69 
 
 		 133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  53.66 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  49.23 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  53.33 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  52.34 
 
 		 133 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  47.33 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  49.6 
 
 		 131 aa  140  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  55.17 
 
 		 131 aa  140  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  47.29 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  49.61 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  48.82 
 
 		 133 aa  138  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  44.96 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  43.41 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  46.09 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  47.69 
 
 		 132 aa  133  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  49.24 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  45.45 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  48.06 
 
 		 133 aa  131  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  44.44 
 
 		 132 aa  130  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  45.24 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  45.38 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  44.09 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  43.41 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  47.24 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  50.77 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  46.46 
 
 		 139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  46.97 
 
 		 133 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  46.88 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  45.04 
 
 		 132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  45.04 
 
 		 132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  44.27 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  46.46 
 
 		 132 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  46.56 
 
 		 133 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  44.88 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  41.27 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  47.06 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  48.7 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  48.7 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  44.17 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  44.62 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  44.19 
 
 		 130 aa  114  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  41.46 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  40.48 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  42.5 
 
 		 137 aa  100  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  44.25 
 
 		 138 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  44.25 
 
 		 138 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1691  hypothetical protein  44.74 
 
 		 138 aa  99.4  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00156174  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0493  hypothetical protein  38.62 
 
 		 151 aa  98.2  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0896666  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05191  hypothetical protein  38.52 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0327196  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05481  hypothetical protein  38.52 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.339637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  45.71 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  37.8 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  45.71 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  34.35 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  44.76 
 
 		 160 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49270  predicted protein  51.11 
 
 		 154 aa  94  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1293  hypothetical protein  40.35 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  39.5 
 
 		 157 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  47.06 
 
 		 138 aa  93.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1152  protein of unknown function UPF0047  37.7 
 
 		 139 aa  93.6  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  hitchhiker  0.00000047058 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  44.76 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  44.76 
 
 		 160 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1688  hypothetical protein  36.59 
 
 		 195 aa  92  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  44.12 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  39.29 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  42.45 
 
 		 139 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  36.57 
 
 		 138 aa  90.9  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6559  protein of unknown function UPF0047  42.86 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552252  normal  0.186603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  41.67 
 
 		 160 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05561  hypothetical protein  37.88 
 
 		 151 aa  90.1  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0078  hypothetical protein  38.57 
 
 		 149 aa  90.1  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  35.77 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  46.67 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  39.37 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  44.86 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3095  hypothetical protein  39.83 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0121064  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07151  hypothetical protein  39.53 
 
 		 156 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  42.48 
 
 		 157 aa  87  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1467  hypothetical protein  38.1 
 
 		 144 aa  87.4  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1102  hypothetical protein  39.42 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2219  hypothetical protein  37.4 
 
 		 140 aa  87  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.457573 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0674  hypothetical protein  40 
 
 		 205 aa  86.7  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.798458  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  35.16 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  43.69 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0564298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>