201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4262 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4262  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 232 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000645522  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0476  hypothetical protein  65.52 
 
 		 238 aa  320  1.9999999999999998e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1036  cobalamin synthesis protein P47K  65.93 
 
 		 227 aa  317  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2095  hypothetical protein  62.56 
 
 		 227 aa  314  8e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.142349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2105  urease and hydrogenase maturation regulator/Ni2+-binding GTPase  62.11 
 
 		 228 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2266  hypothetical protein  63 
 
 		 230 aa  308  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407392  normal  0.68566 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0445  cobalamin synthesis protein P47K  61.84 
 
 		 228 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1675  hypothetical protein  62.11 
 
 		 230 aa  301  5.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1977  cobalamin synthesis protein P47K  60.43 
 
 		 231 aa  301  6.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856485  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2370  cobalamin synthesis protein, P47K  61.23 
 
 		 234 aa  299  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0345  cobalamin synthesis protein, P47K  60.79 
 
 		 232 aa  298  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0743251  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1989  cobalamin synthesis protein P47K  57.14 
 
 		 232 aa  290  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3327  cobalamin synthesis protein, P47K  58.59 
 
 		 227 aa  290  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00470  nickel incorporation protein  57.08 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146336  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02420  nickel incorporation protein  55.41 
 
 		 234 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183496  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2260  cobalamin synthesis protein P47K  54.19 
 
 		 259 aa  261  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1684  hypothetical protein  51.75 
 
 		 230 aa  258  6e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1456  cobalamin synthesis protein, P47K  45.58 
 
 		 232 aa  228  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0687195  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0682  cobalamin synthesis protein, P47K  45.58 
 
 		 232 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1275  cobalamin synthesis protein P47K  44.2 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1283  cobalamin synthesis protein P47K  44.69 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0681  cobalamin synthesis protein P47K  44.64 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1401  cobalamin synthesis protein, P47K  43.75 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.265062  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0155  cobalamin synthesis protein P47K  42.98 
 
 		 236 aa  207  8e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2610  cobalamin synthesis protein P47K  41.99 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000165447  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0500  hypothetical protein  41.15 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0108  cobalamin synthesis protein, P47K  41.15 
 
 		 235 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.83483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2980  cobalamin synthesis protein, P47K  39.21 
 
 		 234 aa  174  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2114  cobalamin synthesis protein, P47K  38.7 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2737  cobalamin synthesis protein P47K  38.05 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1793  cobalamin synthesis protein P47K  37.83 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1067  cobalamin synthesis protein/P47K  37.89 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  31.96 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  27.27 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  27.01 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  27.22 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  25.13 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  24.73 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  24.73 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  26.29 
 
 		 284 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  24.59 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  23.24 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  25.71 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  26.29 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  31.87 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  24.49 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2663  urease accessory protein UreG  28 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093444 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  25.13 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  32.26 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  31.31 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17110  hydrogenase accessory protein HypB  23.81 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  25.26 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1424  urease accessory protein UreG  32.62 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2753  urease accessory protein UreG  29.21 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0806758  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  25.14 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  25.13 
 
 		 280 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19201  urease accessory protein UreG  26.8 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  30.22 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0504  urease accessory protein UreG  31.79 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  26.51 
 
 		 293 aa  52.4  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  27.59 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  31.58 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  30.22 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2360  urease accessory protein  28.76 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  25 
 
 		 254 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  26.78 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  25.99 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  25.9 
 
 		 301 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4213  urease accessory protein UreG  28.66 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  25.58 
 
 		 352 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1049  urease accessory protein UreG  26.29 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.113322  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  25.4 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  24.71 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3080  urease accessory protein UreG  31.13 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0322849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3350  urease accessory protein UreG  31.13 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.632937  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  27.96 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  29.28 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  24.49 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  26.32 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  25.18 
 
 		 296 aa  49.7  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  23.43 
 
 		 303 aa  49.3  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  27.09 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0380  urease accessory protein UreG  25.26 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2803  urease accessory protein UreG  28.4 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11880  urease accessory protein ureG  29.41 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.405112 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2847  urease accessory protein UreG  28.4 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3107  urease accessory protein UreG  28.73 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2830  urease accessory protein UreG  28.4 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  26.59 
 
 		 297 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  25.86 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2997  urease accessory protein UreG  28.34 
 
 		 203 aa  49.3  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.787106 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  24.71 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4441  urease accessory protein UreG  25.91 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  29.63 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2251  urease accessory protein UreG  31.29 
 
 		 201 aa  48.9  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1946  urease accessory protein UreG  28.48 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00965207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0992  urease accessory protein UreG  27.81 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  23.84 
 
 		 252 aa  48.5  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1933  hydrogenase nickel incorporation protein  22.4 
 
 		 223 aa  48.5  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.125072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  25.17 
 
 		 268 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>