More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3342 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3342  Polyprenyl synthetase  100 
 
 
331 aa  676    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000667178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.18 
 
 
320 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.18 
 
 
323 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.18 
 
 
323 aa  199  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.18 
 
 
320 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.18 
 
 
320 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.18 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.85 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.18 
 
 
320 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.18 
 
 
320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.85 
 
 
320 aa  196  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  34.2 
 
 
322 aa  192  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1698  polyprenyl synthetase  37.37 
 
 
349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_332  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.45 
 
 
324 aa  189  8e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1254  Polyprenyl synthetase  39.6 
 
 
337 aa  188  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  39.01 
 
 
322 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  33.66 
 
 
320 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.28 
 
 
323 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.45 
 
 
324 aa  186  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2323  polyprenyl synthetase  38.57 
 
 
349 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.19 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  39.55 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.28 
 
 
320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.69 
 
 
321 aa  182  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.31 
 
 
320 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.66 
 
 
326 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.44 
 
 
320 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  34.94 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  35.79 
 
 
323 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  32.62 
 
 
324 aa  178  9e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  39.37 
 
 
323 aa  178  9e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  34.74 
 
 
323 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  38.19 
 
 
322 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  36.49 
 
 
323 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  36.59 
 
 
323 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  34.37 
 
 
324 aa  176  7e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35.54 
 
 
323 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  36.14 
 
 
323 aa  175  9e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0369  polyprenyl synthetase  35.48 
 
 
324 aa  175  9e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000634343  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  37.5 
 
 
323 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  33.33 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  33.33 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  34.29 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35.19 
 
 
323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  33.44 
 
 
324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  34.81 
 
 
343 aa  173  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  33.68 
 
 
323 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18951  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  36.71 
 
 
323 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  33.01 
 
 
324 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1320  trans-hexaprenyltranstransferase  38.19 
 
 
323 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195026  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  32.7 
 
 
319 aa  170  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  34.51 
 
 
328 aa  169  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 
323 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  36.24 
 
 
333 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  36.24 
 
 
333 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.87 
 
 
322 aa  169  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  36.46 
 
 
323 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  34.08 
 
 
318 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  32.78 
 
 
324 aa  168  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  33.87 
 
 
336 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  35.89 
 
 
333 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  31.58 
 
 
324 aa  168  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  34.15 
 
 
340 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  34.74 
 
 
336 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  34.97 
 
 
322 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  34.81 
 
 
322 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  29.27 
 
 
326 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  33.23 
 
 
319 aa  166  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  33.23 
 
 
319 aa  166  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  34.04 
 
 
336 aa  165  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  36.46 
 
 
338 aa  165  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  33.22 
 
 
322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  34.04 
 
 
336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  32.72 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  34.04 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06831  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  36.11 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  34.97 
 
 
332 aa  163  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  36.46 
 
 
339 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  34.39 
 
 
336 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  33.55 
 
 
356 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  33.8 
 
 
338 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  34.51 
 
 
322 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  30.19 
 
 
311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  34.97 
 
 
332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  35.54 
 
 
360 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  33.77 
 
 
326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  35.76 
 
 
331 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  31.17 
 
 
318 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  34.62 
 
 
340 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  34.62 
 
 
340 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  34.04 
 
 
336 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  35.09 
 
 
333 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  34.28 
 
 
336 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  34.74 
 
 
348 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  36.33 
 
 
323 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0567  Farnesyltranstransferase  35.56 
 
 
338 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  34.29 
 
 
358 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  32.42 
 
 
338 aa  160  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  33.33 
 
 
336 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>