More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2242 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 334 aa  679    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  51.52 
 
 		 354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  50.61 
 
 		 328 aa  323  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  50.76 
 
 		 332 aa  317  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  47.75 
 
 		 328 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  48.48 
 
 		 324 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  48.34 
 
 		 330 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  51.23 
 
 		 337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  48.04 
 
 		 330 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  48.04 
 
 		 330 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  48.04 
 
 		 330 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  45.29 
 
 		 328 aa  311  6.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  47.73 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  47.73 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  47.73 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  46.39 
 
 		 327 aa  310  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 		 324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  46.97 
 
 		 337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  47.73 
 
 		 330 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  48.94 
 
 		 330 aa  309  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  50.3 
 
 		 328 aa  309  5e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  46.83 
 
 		 329 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  46.97 
 
 		 337 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  50.45 
 
 		 329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  46.83 
 
 		 327 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  48.79 
 
 		 328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  47.9 
 
 		 330 aa  305  6e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  47.27 
 
 		 332 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  48.2 
 
 		 327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  47.09 
 
 		 333 aa  304  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  47.15 
 
 		 331 aa  302  5.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  44.14 
 
 		 330 aa  302  5.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  48.65 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  50.76 
 
 		 350 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  45.35 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  49.7 
 
 		 337 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  49.39 
 
 		 331 aa  298  6e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  45.35 
 
 		 328 aa  298  7e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  48.51 
 
 		 337 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  47.31 
 
 		 329 aa  298  9e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  47.31 
 
 		 326 aa  297  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  48.62 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  46.57 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 		 331 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  49.69 
 
 		 330 aa  295  7e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  45.05 
 
 		 328 aa  295  8e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  46.95 
 
 		 324 aa  294  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  48.01 
 
 		 332 aa  295  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  47.88 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  46.99 
 
 		 327 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  44.74 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  44.74 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  47.31 
 
 		 336 aa  293  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  48.31 
 
 		 328 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  47.15 
 
 		 330 aa  292  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  45.85 
 
 		 326 aa  291  7e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 		 329 aa  292  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  46.48 
 
 		 332 aa  291  9e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  49.38 
 
 		 327 aa  291  9e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  46.27 
 
 		 328 aa  291  9e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  47.42 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  41.57 
 
 		 328 aa  290  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 328 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  46.93 
 
 		 323 aa  289  4e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  52.01 
 
 		 322 aa  289  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  43.31 
 
 		 341 aa  289  4e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  45.37 
 
 		 331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  44.74 
 
 		 332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  47.56 
 
 		 330 aa  288  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  47.29 
 
 		 334 aa  288  7e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  47.71 
 
 		 337 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  48 
 
 		 329 aa  288  8e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  48.93 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  46.79 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  48.47 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  46.97 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  48.47 
 
 		 327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  43.24 
 
 		 334 aa  286  4e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  48.62 
 
 		 329 aa  286  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  47.71 
 
 		 337 aa  285  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  47.69 
 
 		 338 aa  285  8e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  47.71 
 
 		 332 aa  285  8e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  42.94 
 
 		 330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  49.24 
 
 		 326 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  48.48 
 
 		 329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  44.79 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  44.48 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  47.69 
 
 		 329 aa  283  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  47.71 
 
 		 330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  44.95 
 
 		 332 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  44.95 
 
 		 332 aa  281  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 325 aa  281  8.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  43.37 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  46.5 
 
 		 331 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>