197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1898 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1898  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  568  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.652332  normal  0.220603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0315  protein of unknown function DUF72  54.55 
 
 
266 aa  294  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2992  hypothetical protein  52.04 
 
 
272 aa  286  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0078078  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0310  hypothetical protein  45.76 
 
 
279 aa  233  3e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000867171  normal  0.131792 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1936  hypothetical protein  45.69 
 
 
272 aa  227  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2229  hypothetical protein  44.94 
 
 
272 aa  223  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0268  hypothetical protein  40.31 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5255  protein of unknown function DUF72  35.69 
 
 
280 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.455274  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1160  hypothetical protein  34.47 
 
 
261 aa  142  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0500427  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1295  hypothetical protein  34.47 
 
 
261 aa  142  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0235  hypothetical protein  34.09 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0459  protein of unknown function DUF72  37.13 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0458  protein of unknown function DUF72  36.76 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0430  hypothetical protein  36.76 
 
 
298 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4140  hypothetical protein  36.67 
 
 
296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950206  hitchhiker  0.001504 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0720  hypothetical protein  32.2 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0778  hypothetical protein  31.01 
 
 
250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2030  protein of unknown function DUF72  30.1 
 
 
318 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000273114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2197  protein of unknown function DUF72  29.07 
 
 
295 aa  109  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00260465  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  30.68 
 
 
387 aa  109  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0920  hypothetical protein  28.74 
 
 
282 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.106512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0939  hypothetical protein  28.74 
 
 
282 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3062  protein of unknown function DUF72  32.84 
 
 
286 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  30.27 
 
 
240 aa  102  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0508  hypothetical protein  26.3 
 
 
282 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  32.81 
 
 
256 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0421  protein of unknown function DUF72  26.94 
 
 
267 aa  100  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.738835  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0209  hypothetical protein  28.62 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1514  hypothetical protein  29.15 
 
 
281 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1584  hypothetical protein  27.62 
 
 
281 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.487764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1620  hypothetical protein  27.62 
 
 
281 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  27.55 
 
 
237 aa  94  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  30 
 
 
243 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0131  hypothetical protein  31.37 
 
 
240 aa  94  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.333529  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2914  protein of unknown function DUF72  30 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1341  hypothetical protein  27.62 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1340  hypothetical protein  27.62 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.462218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1551  hypothetical protein  27.62 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199195 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3831  hypothetical protein  27.51 
 
 
281 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000400731 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1368  hypothetical protein  27.27 
 
 
281 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1479  hypothetical protein  27.27 
 
 
281 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  28.24 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  28.57 
 
 
252 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  26.64 
 
 
242 aa  90.1  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1183  hypothetical protein  25 
 
 
281 aa  89.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000897763  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1873  protein of unknown function DUF72  30.17 
 
 
293 aa  89.4  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  29.66 
 
 
248 aa  89.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  30.24 
 
 
245 aa  89.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  30.24 
 
 
245 aa  89.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  29.17 
 
 
261 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4589  hypothetical protein  25.91 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.135422  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1382  hypothetical protein  27.43 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5493  hypothetical protein  25.44 
 
 
321 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.0343585 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  28.79 
 
 
293 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  28.36 
 
 
261 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1271  protein of unknown function DUF72  31.12 
 
 
284 aa  85.5  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000066434  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  30.42 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  28.74 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  28.74 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1385  hypothetical protein  30.13 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  28.74 
 
 
244 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  25.48 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  29.39 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  27.86 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6611  protein of unknown function DUF72  26.01 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3896  hypothetical protein  25.35 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5842  protein of unknown function DUF72  26.09 
 
 
306 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.852032  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  25.29 
 
 
246 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  28.57 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2045  hypothetical protein  26.06 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.148398  normal  0.484103 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  29.86 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  30.43 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  28.74 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  26.74 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  28.24 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  28.52 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  27.68 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  27.65 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  26.36 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1082  protein of unknown function DUF72  30.95 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00357332  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  27.8 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  27.64 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  27.21 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  27.48 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2017  hypothetical protein  33.65 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  26.59 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  26.19 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  29.32 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  27.31 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9014  hypothetical protein  29.55 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  26.4 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  27.24 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1134  hypothetical protein  27.35 
 
 
231 aa  65.1  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.324615 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0205  hypothetical protein  30.24 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.967531 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  28.73 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  26.77 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  27.37 
 
 
247 aa  62.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0190  hypothetical protein  27.76 
 
 
256 aa  62.4  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.665614  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  25.95 
 
 
241 aa  62  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1263  hypothetical protein  33.17 
 
 
231 aa  61.6  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.593112  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>