191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1432 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1432  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 95 aa  179  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.195476 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0947  ribosomal protein S20  67.78 
 
 		 97 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.351712 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0847  30S ribosomal protein S20  68.83 
 
 		 97 aa  91.3  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  53.25 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  53.09 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  48.68 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  50 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1851  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153363  hitchhiker  0.000963738 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0524  ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000452156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 93 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  43.42 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0238  30S ribosomal protein S20  43.24 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00017388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  44.74 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  43.24 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  42.67 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  42.67 
 
 		 88 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 89 aa  49.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  41.11 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  42.67 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  42.67 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  42.67 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  42.67 
 
 		 88 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  42.67 
 
 		 88 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  42.67 
 
 		 88 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  42.67 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  41.03 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  43.18 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  41.03 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  41.33 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  45.33 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  46.25 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  37.35 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  42.31 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0389  30S ribosomal protein S20  41.46 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.17035  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  41.33 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0819  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3274  ribosomal protein S20  46.05 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  42.67 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  42.67 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  47.56 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1710  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000312483  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  44 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477404  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  44 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0424  30S ribosomal protein S20  41.46 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2726  30S ribosomal protein S20  42.67 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000316732  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  36.46 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0211  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000112504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0196  ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3191  ribosomal protein S20  51.47 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00000247507  normal  0.0669339 
 
 
-
 
NC_002978  WD1150  30S ribosomal protein S20  42.11 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00399464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  39.74 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004422  SSU ribosomal protein S20p  42.11 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000816133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1080  30S ribosomal protein S20  44.74 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000335633  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  44 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>