130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1012 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1012  hypothetical protein  100 
 
 		 560 aa  1115    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262179  hitchhiker  0.000000557566 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1254  protein of unknown function DUF205  58.41 
 
 		 574 aa  608  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0989  hypothetical protein  59.75 
 
 		 556 aa  590  1e-167  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.39207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.74 
 
 		 371 aa  159  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.96 
 
 		 370 aa  151  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.47 
 
 		 362 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00730  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.18 
 
 		 362 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000274075  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1649  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.68 
 
 		 359 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0150  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.88 
 
 		 360 aa  141  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.86 
 
 		 357 aa  140  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.53 
 
 		 685 aa  135  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.23 
 
 		 685 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.68 
 
 		 691 aa  131  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.42 
 
 		 681 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.79 
 
 		 364 aa  123  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  29.86 
 
 		 728 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  29.86 
 
 		 728 aa  115  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  30.96 
 
 		 684 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  29.43 
 
 		 707 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  29.13 
 
 		 707 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  28.84 
 
 		 710 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  29.2 
 
 		 720 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  29.85 
 
 		 689 aa  97.1  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  29.03 
 
 		 957 aa  94  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  31.39 
 
 		 891 aa  77  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  24.16 
 
 		 845 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5680  hypothetical protein  25.19 
 
 		 366 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0387198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.5 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2534  hypothetical protein  26.14 
 
 		 339 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  23.81 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1594  hypothetical protein  27.97 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.293919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2279  hypothetical protein  24.84 
 
 		 339 aa  67  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1864  dehydrogenase  23.47 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2973  aminotransferase class-III  23.29 
 
 		 956 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.73 
 
 		 339 aa  63.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121651  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2782  pyridoxalphosphate dependent aminotransferase, class III  24.19 
 
 		 959 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  32.37 
 
 		 193 aa  62.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0399  hypothetical protein  23.57 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247515  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  31.28 
 
 		 201 aa  62  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  31.58 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1634  hypothetical protein  24.48 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.509196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  31.78 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0178  membrane protein  30.59 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.945445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  30.29 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13811  membrane protein  30.43 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3022  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.27 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.1 
 
 		 197 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  32.87 
 
 		 210 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  32.41 
 
 		 226 aa  59.7  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4727  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.9 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  27.23 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  31.84 
 
 		 194 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  32.56 
 
 		 224 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  38.38 
 
 		 198 aa  56.6  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  29.95 
 
 		 196 aa  56.2  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  27.67 
 
 		 198 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  25.52 
 
 		 955 aa  55.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  32.99 
 
 		 200 aa  54.3  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.78 
 
 		 203 aa  53.5  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1643  protein of unknown function DUF205  31.51 
 
 		 212 aa  53.5  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  27.18 
 
 		 198 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0924  membrane protein  26.8 
 
 		 205 aa  53.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1616  hypothetical protein  28.18 
 
 		 202 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.17 
 
 		 201 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0729  hypothetical protein  22.79 
 
 		 346 aa  52.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.36 
 
 		 215 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1851  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.02 
 
 		 226 aa  52.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2753  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.8 
 
 		 206 aa  52.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  33.17 
 
 		 201 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2243  protein of unknown function DUF205  32.8 
 
 		 211 aa  52.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.341308  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  26.32 
 
 		 195 aa  52  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  33.97 
 
 		 205 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  28.84 
 
 		 200 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  34.91 
 
 		 200 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  28.43 
 
 		 196 aa  51.2  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1944  membrane protein  30.04 
 
 		 242 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3050  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.32 
 
 		 228 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  31.78 
 
 		 203 aa  50.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  26.5 
 
 		 195 aa  50.8  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.18 
 
 		 203 aa  50.8  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2284  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  31.58 
 
 		 198 aa  50.4  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.278877  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0104  membrane protein  27.57 
 
 		 223 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2305  hypothetical protein  27.09 
 
 		 277 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2278  hypothetical protein  28.16 
 
 		 277 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0172  membrane protein  30.77 
 
 		 200 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.8 
 
 		 196 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  35.85 
 
 		 194 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3030  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.33 
 
 		 196 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2470  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.56 
 
 		 205 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3856  protein of unknown function DUF205  31.94 
 
 		 204 aa  48.9  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0565232 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1160  protein of unknown function DUF205  38.14 
 
 		 201 aa  48.5  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  27.96 
 
 		 198 aa  47.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  30.92 
 
 		 203 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3272  protein of unknown function DUF205  28.38 
 
 		 217 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2827  protein of unknown function DUF205  28.38 
 
 		 217 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2553  hypothetical protein  30.33 
 
 		 194 aa  47.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  26.47 
 
 		 210 aa  47.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  28.83 
 
 		 219 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2556  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  29.41 
 
 		 213 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477971  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  32.26 
 
 		 211 aa  46.6  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>