More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1339 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  100 
 
 
196 aa  385  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  93.88 
 
 
196 aa  366  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1616  hypothetical protein  49.21 
 
 
202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0813  membrane protein  46.49 
 
 
200 aa  161  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.979835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0924  membrane protein  45.79 
 
 
205 aa  150  8e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  42.47 
 
 
195 aa  145  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  42.21 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.08 
 
 
196 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  40.32 
 
 
203 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.11 
 
 
194 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.4 
 
 
201 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1406  protein of unknown function DUF205  40.41 
 
 
200 aa  134  8e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  40.11 
 
 
204 aa  133  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.09 
 
 
201 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  44.09 
 
 
201 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  41.97 
 
 
200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  41.3 
 
 
210 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0007  membrane protein  39.46 
 
 
191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.386788  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0027  membrane protein  38.5 
 
 
195 aa  129  3e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  41.45 
 
 
214 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1045  membrane protein  41.85 
 
 
192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0514338  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0601  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.76 
 
 
201 aa  128  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  42.33 
 
 
198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0566  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.76 
 
 
201 aa  128  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  37.7 
 
 
198 aa  124  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1357  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.98 
 
 
203 aa  124  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  40.86 
 
 
195 aa  124  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.76 
 
 
200 aa  123  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  41.21 
 
 
207 aa  123  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3095  protein of unknown function DUF205  39.25 
 
 
203 aa  122  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0484205  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  39.04 
 
 
200 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0051  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.02 
 
 
208 aa  122  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00859928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.62 
 
 
197 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2553  hypothetical protein  38.3 
 
 
194 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.96 
 
 
203 aa  121  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0917  protein of unknown function DUF205  36.76 
 
 
191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2907  membrane protein  39.23 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000899467 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  38.5 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10540  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.56 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3022  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40 
 
 
194 aa  119  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.32 
 
 
196 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4296  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.96 
 
 
212 aa  118  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0033487  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0104  membrane protein  42.39 
 
 
223 aa  118  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  41.27 
 
 
194 aa  118  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  38.42 
 
 
203 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0796  protein of unknown function DUF205  41 
 
 
214 aa  117  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348496  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.08 
 
 
203 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0299  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.13 
 
 
216 aa  117  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017898  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0638  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.13 
 
 
216 aa  117  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0557  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.13 
 
 
216 aa  117  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000206924  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1001  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.15 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0144207  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2284  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.3 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.278877  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14881  membrane protein  36.46 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  38.95 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3411  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.5 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0338117  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  37.84 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  40.11 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1643  protein of unknown function DUF205  40.62 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1077  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.23 
 
 
200 aa  115  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.116934  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4727  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.14 
 
 
198 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0827  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.41 
 
 
210 aa  115  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0696875  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0320  protein of unknown function DUF205  37.56 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.254648  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0172  membrane protein  39.56 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.1 
 
 
215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0293  hypothetical protein  37.95 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3570  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.96 
 
 
211 aa  115  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0795951  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1043  hypothetical protein  35.71 
 
 
200 aa  115  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000725883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4194  membrane protein  39.89 
 
 
201 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1594  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.02 
 
 
212 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22068  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0040  hypothetical protein  37.3 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2693  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.78 
 
 
193 aa  114  7.999999999999999e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00164513  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0793  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.59 
 
 
213 aa  114  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.414497  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2985  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.02 
 
 
203 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000527205  normal  0.538474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2417  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.71 
 
 
207 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4339  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.77 
 
 
196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  38.19 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2823  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.22 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.571241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2903  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.02 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000317667  normal  0.0212872 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  36.9 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  37.43 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2260  hypothetical protein  36.84 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001618  acyl-phosphate:glycerol-3-phosphate O-acyltransferase PlsY  41.53 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0411697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  40.11 
 
 
194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1199  protein of unknown function DUF205  33.49 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3030  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.62 
 
 
196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3082  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.02 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000753996  hitchhiker  0.0000265088 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0575  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.69 
 
 
202 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3380  membrane protein  39.9 
 
 
195 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000102812  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0533  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.84 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2753  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.6 
 
 
206 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2243  protein of unknown function DUF205  36.6 
 
 
211 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.341308  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0178  membrane protein  44.09 
 
 
327 aa  111  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.945445  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.54 
 
 
198 aa  111  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1778  membrane protein  34.72 
 
 
219 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0375425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1109  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.5 
 
 
203 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000633116  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  36.52 
 
 
200 aa  111  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0964  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.1 
 
 
190 aa  111  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102328  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3420  hypothetical protein  41.4 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296095  normal  0.610432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1158  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.47 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000140033  normal  0.0384563 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0517  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.32 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0870487  normal  0.527764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>