More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3020 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  100 
 
 		 194 aa  370  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  75.26 
 
 		 194 aa  285  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  74.23 
 
 		 195 aa  282  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  71.2 
 
 		 193 aa  258  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  70.68 
 
 		 193 aa  257  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  66.84 
 
 		 194 aa  228  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  63.49 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  57.81 
 
 		 196 aa  197  7.999999999999999e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  54.04 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  49.74 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  46.28 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.44 
 
 		 200 aa  155  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  47.92 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  45.21 
 
 		 200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  45.69 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0104  membrane protein  43.23 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  43.08 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  43.59 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0178  membrane protein  48.95 
 
 		 327 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.945445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  50.54 
 
 		 192 aa  148  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  47.16 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0172  membrane protein  44.21 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  49.22 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  45.79 
 
 		 195 aa  143  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1944  membrane protein  44.85 
 
 		 242 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  42.71 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  42.71 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  41.13 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  44.26 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.62 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1382  hypothetical protein  45.11 
 
 		 193 aa  141  6e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1323  hypothetical membrane spanning protein  45.11 
 
 		 193 aa  141  6e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.143303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0384  hypothetical protein  52.08 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3809  hypothetical protein  45.45 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0040  hypothetical protein  41.15 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  45.64 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  42.19 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.35 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.62 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2521  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.71 
 
 		 203 aa  137  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635021 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1811  hypothetical protein  42.78 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443893  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0729  protein of unknown function DUF205  42 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.382163  normal  0.327374 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2989  hypothetical protein  45.13 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  50 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2329  hypothetical protein  44.27 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2907  membrane protein  44.22 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000899467 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  43.75 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  43.37 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1111  hypothetical protein  46.24 
 
 		 212 aa  134  8e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0125  protein of unknown function DUF205  44.85 
 
 		 198 aa  134  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.765264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0125  hypothetical protein  44.85 
 
 		 198 aa  134  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.57 
 
 		 201 aa  134  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2058  membrane protein  38.16 
 
 		 235 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2099  membrane protein  43.89 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.960995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2062  hypothetical protein  45.83 
 
 		 202 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0813  membrane protein  39.44 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.979835  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  41.4 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2417  membrane protein  37.99 
 
 		 235 aa  132  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4194  membrane protein  43.88 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  45.08 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  43.41 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  43.81 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.35 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  47.06 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4024  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.81 
 
 		 192 aa  131  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3022  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.54 
 
 		 194 aa  131  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2175  membrane protein  39.91 
 
 		 235 aa  131  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2443  membrane protein  40 
 
 		 235 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0533  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.15 
 
 		 198 aa  130  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1269  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.67 
 
 		 231 aa  130  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.747048  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  44.22 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  42.63 
 
 		 224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2284  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.67 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.278877  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4349  membrane protein  45.41 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.13 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.13 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10540  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.21 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.54 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.13 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2113  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.51 
 
 		 199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  44.1 
 
 		 216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3030  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.51 
 
 		 196 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4339  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.93 
 
 		 196 aa  127  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1389  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.02 
 
 		 206 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.942836  normal  0.154079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0473  hypothetical protein  49.73 
 
 		 201 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537999  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.13 
 
 		 198 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0724  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.72 
 
 		 189 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2816  membrane protein  37.55 
 
 		 235 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.54 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.54 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0829  protein of unknown function DUF205  37.91 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.4 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  42.44 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2025  membrane protein  36.24 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1297  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.57 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114938  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3274  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.14 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.54 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2553  hypothetical protein  47.51 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4727  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.41 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0640  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.66 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000218346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>