More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2417 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2417  membrane protein  100 
 
 
235 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  88.09 
 
 
235 aa  424  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2058  membrane protein  87.66 
 
 
235 aa  414  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2025  membrane protein  86.75 
 
 
234 aa  397  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2816  membrane protein  88.41 
 
 
235 aa  394  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2443  membrane protein  74.47 
 
 
235 aa  361  5.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2175  membrane protein  72.77 
 
 
235 aa  357  9e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1269  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.29 
 
 
231 aa  208  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.747048  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  40.91 
 
 
216 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6513  protein of unknown function DUF205  37.34 
 
 
217 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00773794  normal  0.103654 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.27 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3274  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.27 
 
 
216 aa  141  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  37.55 
 
 
195 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1199  protein of unknown function DUF205  37.97 
 
 
215 aa  137  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.45 
 
 
198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.45 
 
 
198 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.45 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.45 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.02 
 
 
198 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.02 
 
 
198 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  36.17 
 
 
194 aa  131  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.02 
 
 
198 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.02 
 
 
198 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2579  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.44 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.02 
 
 
198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.58 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.68 
 
 
198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  36.21 
 
 
198 aa  128  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  37.16 
 
 
193 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.05 
 
 
198 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3740  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.3 
 
 
215 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  37.16 
 
 
193 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2389  hypothetical protein  37.44 
 
 
209 aa  125  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000658646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3128  hypothetical protein  37.84 
 
 
190 aa  124  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3374  hypothetical protein  37.84 
 
 
190 aa  124  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  34.39 
 
 
194 aa  124  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0796  protein of unknown function DUF205  37.33 
 
 
214 aa  124  9e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348496  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1160  protein of unknown function DUF205  34.21 
 
 
201 aa  124  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  34.08 
 
 
219 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.6 
 
 
215 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10540  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.57 
 
 
208 aa  122  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2907  membrane protein  34.78 
 
 
226 aa  122  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000899467 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1155  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.39 
 
 
212 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327408  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2260  hypothetical protein  36.6 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0781  membrane protein  35.22 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000234105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  34.04 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1025  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.22 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.942008  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  34.38 
 
 
197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  34.65 
 
 
200 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  34.74 
 
 
200 aa  118  7e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3380  membrane protein  37.05 
 
 
195 aa  118  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000102812  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  35.04 
 
 
200 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  34.22 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1415  hypothetical protein  33.19 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.06877  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1442  hypothetical protein  33.19 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0247  protein of unknown function DUF205  36.53 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.491401 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  35 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  38.74 
 
 
195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  34.65 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  33.04 
 
 
197 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  33.78 
 
 
198 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3589  membrane protein  33.91 
 
 
226 aa  115  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933986  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  33.48 
 
 
197 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  34.68 
 
 
198 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14881  membrane protein  33.93 
 
 
198 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.59 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  34.55 
 
 
204 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  33.78 
 
 
195 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0924  hypothetical protein  32.03 
 
 
202 aa  111  9e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190869  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  37.38 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  33.78 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1778  membrane protein  36.02 
 
 
219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0375425 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0417  hypothetical protein  35.71 
 
 
210 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.032273  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0632  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.7 
 
 
213 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1423  protein of unknown function DUF205  30.8 
 
 
220 aa  108  9.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3050  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.34 
 
 
228 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1955  membrane protein  34.91 
 
 
219 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0878963  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  34.33 
 
 
192 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1406  protein of unknown function DUF205  34.96 
 
 
200 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  29 
 
 
203 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3272  protein of unknown function DUF205  31.19 
 
 
217 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2827  protein of unknown function DUF205  31.19 
 
 
217 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0924  membrane protein  35.75 
 
 
205 aa  105  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  35.37 
 
 
198 aa  105  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0829  protein of unknown function DUF205  31.08 
 
 
220 aa  105  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  30.7 
 
 
196 aa  105  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0998  hypothetical protein  35.06 
 
 
219 aa  105  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1111  hypothetical protein  33.48 
 
 
212 aa  105  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0752  protein of unknown function DUF205  36.36 
 
 
202 aa  105  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2057  membrane protein  36.24 
 
 
210 aa  105  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1064  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.93 
 
 
213 aa  105  8e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000173529  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.89 
 
 
203 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1616  hypothetical protein  34.22 
 
 
202 aa  103  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4413  hypothetical protein  34.33 
 
 
204 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.89 
 
 
201 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0813  membrane protein  34.25 
 
 
200 aa  102  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.979835  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2099  membrane protein  32.24 
 
 
203 aa  101  8e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1205  membrane protein  33.33 
 
 
216 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  34.07 
 
 
224 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13811  membrane protein  33.63 
 
 
206 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>