More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1269 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1269  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  100 
 
 
231 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.747048  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2443  membrane protein  51.52 
 
 
235 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  49.79 
 
 
235 aa  223  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2175  membrane protein  52.12 
 
 
235 aa  222  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2058  membrane protein  49.35 
 
 
235 aa  218  7e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2417  membrane protein  47.01 
 
 
235 aa  207  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2025  membrane protein  47.44 
 
 
234 aa  206  4e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2816  membrane protein  46.96 
 
 
235 aa  205  6e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1199  protein of unknown function DUF205  43.54 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  43.6 
 
 
216 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6513  protein of unknown function DUF205  42.92 
 
 
217 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00773794  normal  0.103654 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.55 
 
 
198 aa  158  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.55 
 
 
198 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.55 
 
 
198 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.55 
 
 
198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.55 
 
 
198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.55 
 
 
198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.55 
 
 
198 aa  155  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.55 
 
 
198 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.08 
 
 
198 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.08 
 
 
198 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.92 
 
 
198 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.75 
 
 
197 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.86 
 
 
200 aa  150  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1160  protein of unknown function DUF205  40.09 
 
 
201 aa  146  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2579  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.22 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  40.37 
 
 
207 aa  143  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  40.47 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3274  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.1 
 
 
216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.45 
 
 
215 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3740  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.27 
 
 
215 aa  138  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0924  hypothetical protein  40.18 
 
 
202 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3128  hypothetical protein  40.38 
 
 
190 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3374  hypothetical protein  40.38 
 
 
190 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1415  hypothetical protein  40.47 
 
 
202 aa  135  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.06877  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1442  hypothetical protein  40.47 
 
 
202 aa  135  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  41.59 
 
 
200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  38.73 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  42.93 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  36.67 
 
 
197 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  42.86 
 
 
195 aa  131  7.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2130  protein of unknown function DUF205  37.79 
 
 
212 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.183332  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3050  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.09 
 
 
228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  39.61 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2389  hypothetical protein  35.41 
 
 
209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000658646  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  38.76 
 
 
197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0247  protein of unknown function DUF205  43.41 
 
 
222 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.491401 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  37.32 
 
 
197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0781  membrane protein  38.5 
 
 
209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000234105  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  38.97 
 
 
219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  35 
 
 
203 aa  128  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  40 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  37.91 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  36.02 
 
 
200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0752  protein of unknown function DUF205  38.39 
 
 
202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1423  protein of unknown function DUF205  39.27 
 
 
220 aa  126  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10540  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.41 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  39.07 
 
 
198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  39.9 
 
 
193 aa  124  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  39.9 
 
 
193 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1155  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.92 
 
 
212 aa  123  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327408  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0796  protein of unknown function DUF205  40.55 
 
 
214 aa  123  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348496  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14881  membrane protein  36.67 
 
 
198 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  38.5 
 
 
196 aa  121  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.81 
 
 
210 aa  121  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  40.76 
 
 
192 aa  121  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0829  protein of unknown function DUF205  36.87 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  38.05 
 
 
204 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  34.62 
 
 
198 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  34.13 
 
 
198 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1025  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.94 
 
 
207 aa  120  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.942008  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  41.06 
 
 
198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  38.58 
 
 
200 aa  119  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.34 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0417  hypothetical protein  36.92 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.032273  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  40 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1064  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.92 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000173529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  42.55 
 
 
194 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  38.05 
 
 
205 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  37.5 
 
 
196 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.91 
 
 
201 aa  115  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2907  membrane protein  38.39 
 
 
226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000899467 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1406  protein of unknown function DUF205  37.91 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0575  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.29 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2057  membrane protein  42.79 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1365  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.57 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.017973  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  40.38 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  37.02 
 
 
196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0155  protein of unknown function DUF205  38.39 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.337449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3380  membrane protein  36.49 
 
 
195 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000102812  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.16 
 
 
203 aa  113  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0293  hypothetical protein  38.57 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1396  membrane protein  33.95 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  35.51 
 
 
203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  37.61 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1955  membrane protein  40.38 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0878963  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0729  protein of unknown function DUF205  34.78 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.382163  normal  0.327374 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0917  protein of unknown function DUF205  35.38 
 
 
191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  36.71 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0320  protein of unknown function DUF205  40.38 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.254648  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>