More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0829 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0829  protein of unknown function DUF205  100 
 
 
220 aa  434  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  39.63 
 
 
195 aa  141  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  40.38 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4349  membrane protein  41.55 
 
 
201 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0796  protein of unknown function DUF205  40.89 
 
 
214 aa  138  4.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348496  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4194  membrane protein  39.61 
 
 
201 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  39.25 
 
 
194 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  38.79 
 
 
193 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4326  membrane protein  40.58 
 
 
201 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  39.81 
 
 
195 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  36.89 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  38.6 
 
 
193 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1406  protein of unknown function DUF205  37.1 
 
 
200 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  38.89 
 
 
200 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  40.67 
 
 
194 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0384  hypothetical protein  40 
 
 
209 aa  123  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4413  hypothetical protein  37.79 
 
 
204 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  36.45 
 
 
207 aa  122  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  39.45 
 
 
201 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.45 
 
 
201 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2057  membrane protein  41.23 
 
 
210 aa  122  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3022  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.58 
 
 
194 aa  122  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2827  protein of unknown function DUF205  38.1 
 
 
217 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3272  protein of unknown function DUF205  38.1 
 
 
217 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  38.18 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  40.28 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.79 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  37.85 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2907  membrane protein  37.72 
 
 
226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000899467 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1616  hypothetical protein  37.68 
 
 
202 aa  118  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.25 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  38.83 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3050  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.5 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  37.5 
 
 
194 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1269  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.87 
 
 
231 aa  116  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.747048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.99 
 
 
198 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1778  membrane protein  39.35 
 
 
219 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0375425 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.99 
 
 
198 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.57 
 
 
198 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1955  membrane protein  38.43 
 
 
219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0878963  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.57 
 
 
198 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.82 
 
 
198 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.04 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.04 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.57 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.57 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.57 
 
 
198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.57 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  37.04 
 
 
196 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  36.84 
 
 
198 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0982  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.07 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00892107  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2579  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.24 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06900  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00023  37.86 
 
 
219 aa  112  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.704538 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3589  membrane protein  33.63 
 
 
226 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933986  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  41.26 
 
 
214 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  35.94 
 
 
203 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2260  hypothetical protein  36.94 
 
 
226 aa  112  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  35.94 
 
 
196 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0027  membrane protein  37.98 
 
 
195 aa  111  9e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0917  protein of unknown function DUF205  35.35 
 
 
191 aa  111  9e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.33 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  33.04 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0247  protein of unknown function DUF205  40.58 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.491401 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  36.92 
 
 
198 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  36.45 
 
 
198 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  36.28 
 
 
200 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1199  protein of unknown function DUF205  34.55 
 
 
215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  36.87 
 
 
196 aa  108  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2099  membrane protein  38.24 
 
 
203 aa  108  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0729  protein of unknown function DUF205  36.97 
 
 
220 aa  108  8.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.382163  normal  0.327374 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  35.62 
 
 
198 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1504  hypothetical protein  34.88 
 
 
204 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0007  membrane protein  36.23 
 
 
191 aa  107  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.386788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5145  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.92 
 
 
189 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_002936  DET1396  membrane protein  33.94 
 
 
216 aa  106  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0924  hypothetical protein  35.51 
 
 
202 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1109  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.71 
 
 
203 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000633116  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.11 
 
 
194 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0051  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.11 
 
 
208 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00859928  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2985  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.25 
 
 
203 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000527205  normal  0.538474 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2903  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.25 
 
 
203 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000317667  normal  0.0212872 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2062  hypothetical protein  35.93 
 
 
202 aa  105  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1338  protein of unknown function DUF205  36.44 
 
 
222 aa  105  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.265905  normal  0.438388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3082  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.25 
 
 
203 aa  104  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000753996  hitchhiker  0.0000265088 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2553  hypothetical protein  37.73 
 
 
194 aa  105  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2417  membrane protein  31.08 
 
 
235 aa  104  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2175  membrane protein  30 
 
 
235 aa  104  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1178  hypothetical protein  33.94 
 
 
216 aa  104  9e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4024  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.79 
 
 
192 aa  104  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.35 
 
 
201 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1290  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.33 
 
 
203 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2025  membrane protein  32.44 
 
 
234 aa  104  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2816  membrane protein  32.91 
 
 
235 aa  104  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.51 
 
 
203 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_002978  WD1045  membrane protein  44.72 
 
 
192 aa  103  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0514338  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1205  membrane protein  33.94 
 
 
216 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  35 
 
 
226 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0104  membrane protein  33.64 
 
 
223 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1643  protein of unknown function DUF205  37.91 
 
 
212 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1187  protein of unknown function DUF205  36.32 
 
 
196 aa  103  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000281015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>