More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1778 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1778  membrane protein  100 
 
 
219 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0375425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1955  membrane protein  83.11 
 
 
219 aa  357  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0878963  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3589  membrane protein  63.01 
 
 
226 aa  274  7e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933986  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2907  membrane protein  57.97 
 
 
226 aa  224  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000899467 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2260  hypothetical protein  55.56 
 
 
226 aa  215  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3050  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  51.14 
 
 
228 aa  207  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  57.21 
 
 
219 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0247  protein of unknown function DUF205  57 
 
 
222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.491401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3272  protein of unknown function DUF205  51.4 
 
 
217 aa  188  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2827  protein of unknown function DUF205  51.4 
 
 
217 aa  188  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2057  membrane protein  52.2 
 
 
210 aa  170  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  45.96 
 
 
200 aa  154  9e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2099  membrane protein  44.95 
 
 
203 aa  152  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  48.57 
 
 
205 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  43.87 
 
 
198 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  43.87 
 
 
198 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14881  membrane protein  40.19 
 
 
198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  39.9 
 
 
197 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  39.13 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  38.54 
 
 
203 aa  133  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13811  membrane protein  43.4 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  39.61 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.55 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  37.62 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  38.73 
 
 
200 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2579  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.9 
 
 
197 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  39.42 
 
 
198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1509  hypothetical protein  42.18 
 
 
215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1406  protein of unknown function DUF205  40.48 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  42.23 
 
 
194 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  40.29 
 
 
200 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.98 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  36.97 
 
 
195 aa  115  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0752  protein of unknown function DUF205  37.2 
 
 
202 aa  115  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0829  protein of unknown function DUF205  39.35 
 
 
220 aa  115  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.56 
 
 
197 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.98 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.2 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.98 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3380  membrane protein  36.76 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000102812  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  39.51 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.2 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.2 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.2 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.2 
 
 
198 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.2 
 
 
198 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  41.67 
 
 
198 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.71 
 
 
198 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.71 
 
 
198 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  34.72 
 
 
196 aa  111  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1396  membrane protein  38.79 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0417  hypothetical protein  37.68 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.032273  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  40.1 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.1 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1205  membrane protein  38.43 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  39.61 
 
 
214 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0924  hypothetical protein  36.19 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190869  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  42.31 
 
 
195 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  40.67 
 
 
210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1178  hypothetical protein  37.96 
 
 
216 aa  108  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  40 
 
 
194 aa  108  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3095  protein of unknown function DUF205  41.78 
 
 
203 aa  108  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0484205  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  34.91 
 
 
235 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.13 
 
 
215 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.29 
 
 
200 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2417  membrane protein  36.21 
 
 
235 aa  106  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  34.31 
 
 
196 aa  106  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1442  hypothetical protein  36.36 
 
 
202 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2175  membrane protein  36.75 
 
 
235 aa  105  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1415  hypothetical protein  36.36 
 
 
202 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.06877  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3089  hypothetical protein  39.62 
 
 
196 aa  105  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.286384  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  40.1 
 
 
193 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  39.6 
 
 
193 aa  104  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  40.67 
 
 
198 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2816  membrane protein  33.91 
 
 
235 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2470  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.96 
 
 
205 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1160  protein of unknown function DUF205  32.84 
 
 
201 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6513  protein of unknown function DUF205  37.2 
 
 
217 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00773794  normal  0.103654 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  35.1 
 
 
198 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1023  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.85 
 
 
219 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0416412  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2443  membrane protein  36.21 
 
 
235 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2113  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.04 
 
 
199 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2130  protein of unknown function DUF205  35.78 
 
 
212 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.183332  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2025  membrane protein  34.78 
 
 
234 aa  101  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  37.5 
 
 
203 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4413  hypothetical protein  39.44 
 
 
204 aa  101  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0796  protein of unknown function DUF205  38.5 
 
 
214 aa  101  8e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348496  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  36.11 
 
 
211 aa  100  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2553  hypothetical protein  40.58 
 
 
194 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  36.97 
 
 
216 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0155  protein of unknown function DUF205  38.46 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.337449 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1269  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.72 
 
 
231 aa  99.8  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.747048  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1199  protein of unknown function DUF205  33.01 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1643  protein of unknown function DUF205  39.46 
 
 
212 aa  99.4  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.7 
 
 
203 aa  99  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2058  membrane protein  33.19 
 
 
235 aa  98.2  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4194  membrane protein  35.81 
 
 
201 aa  98.2  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  40 
 
 
198 aa  98.2  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0781  membrane protein  37.8 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000234105  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.44 
 
 
201 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>