More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0651 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  100 
 
 
196 aa  387  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  56.63 
 
 
194 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  57.14 
 
 
194 aa  208  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  57.29 
 
 
198 aa  206  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  54.08 
 
 
195 aa  204  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  56.54 
 
 
193 aa  204  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  55.5 
 
 
193 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  56.91 
 
 
194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.79 
 
 
215 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  44.9 
 
 
207 aa  160  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.3 
 
 
200 aa  155  3e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  48.39 
 
 
192 aa  154  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  44.72 
 
 
195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0384  hypothetical protein  46.88 
 
 
209 aa  150  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.13 
 
 
203 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4194  membrane protein  47.15 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  46.15 
 
 
203 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0040  hypothetical protein  38.34 
 
 
197 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.56 
 
 
201 aa  145  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0575  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.02 
 
 
202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2989  hypothetical protein  42.08 
 
 
198 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0155  protein of unknown function DUF205  42.16 
 
 
208 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.337449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.37 
 
 
203 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  43.09 
 
 
203 aa  141  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0533  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.09 
 
 
198 aa  140  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  40.89 
 
 
224 aa  141  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2329  hypothetical protein  43.92 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4637  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.67 
 
 
192 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4024  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.85 
 
 
192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2062  hypothetical protein  43.16 
 
 
202 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.1 
 
 
196 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1158  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.8 
 
 
202 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000140033  normal  0.0384563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2284  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.95 
 
 
198 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.278877  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  42.93 
 
 
211 aa  136  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  44.04 
 
 
200 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  42.55 
 
 
200 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0601  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.5 
 
 
201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0566  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.5 
 
 
201 aa  135  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0172  membrane protein  39.58 
 
 
200 aa  135  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3095  protein of unknown function DUF205  45.21 
 
 
203 aa  135  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0484205  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.24 
 
 
196 aa  134  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  40.64 
 
 
204 aa  134  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4349  membrane protein  46.88 
 
 
201 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1077  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.78 
 
 
200 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.116934  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2521  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.43 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.635021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5145  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.82 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  41.62 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1811  hypothetical protein  42.78 
 
 
209 aa  132  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443893  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1643  protein of unknown function DUF205  44.06 
 
 
212 aa  132  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0517  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.78 
 
 
202 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0870487  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1001  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.55 
 
 
203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0144207  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.27 
 
 
210 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4326  membrane protein  45.92 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  41.15 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  40.31 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0027  membrane protein  41.97 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  39.58 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2579  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.47 
 
 
197 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2823  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.31 
 
 
207 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.571241 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0724  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.07 
 
 
189 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1594  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.41 
 
 
212 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22068  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0178  membrane protein  41.15 
 
 
327 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.945445  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0541  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  39.58 
 
 
198 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07580  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.07 
 
 
189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0346741 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10540  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.21 
 
 
208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  41.67 
 
 
197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2829  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.8 
 
 
204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000278679  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0473  hypothetical protein  45.6 
 
 
201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537999  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  40.84 
 
 
203 aa  128  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  40.98 
 
 
226 aa  127  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  44.22 
 
 
198 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  42.11 
 
 
195 aa  128  7.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2546  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.16 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0007  membrane protein  44.74 
 
 
191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.386788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3380  membrane protein  43.52 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000102812  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.41 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  40.1 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  42.56 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1070  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.49 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0914  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.49 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0918  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.49 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2417  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.79 
 
 
207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1509  hypothetical protein  46.63 
 
 
215 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0740  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.49 
 
 
212 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4339  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.14 
 
 
196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0104  membrane protein  38.59 
 
 
223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2278  hypothetical protein  37.44 
 
 
277 aa  125  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0964  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.64 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102328  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2305  hypothetical protein  37.44 
 
 
277 aa  124  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6612  protein of unknown function DUF205  47.03 
 
 
197 aa  124  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0697451 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0121  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.96 
 
 
203 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0372  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.96 
 
 
203 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2507  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.96 
 
 
203 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0753  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.27 
 
 
214 aa  124  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1043  hypothetical protein  39.18 
 
 
200 aa  124  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000725883  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0672  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.96 
 
 
203 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2553  hypothetical protein  43.41 
 
 
194 aa  124  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2903  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.82 
 
 
203 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000317667  normal  0.0212872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2985  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.82 
 
 
203 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000527205  normal  0.538474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>