More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1955 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1955  membrane protein  100 
 
 
219 aa  424  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0878963  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1778  membrane protein  83.11 
 
 
219 aa  357  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0375425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3589  membrane protein  58.45 
 
 
226 aa  262  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933986  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2907  membrane protein  57.75 
 
 
226 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000899467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3050  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  52.29 
 
 
228 aa  214  8e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2260  hypothetical protein  53.85 
 
 
226 aa  211  4.9999999999999996e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  55.56 
 
 
219 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0247  protein of unknown function DUF205  55.5 
 
 
222 aa  194  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.491401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2827  protein of unknown function DUF205  50.47 
 
 
217 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3272  protein of unknown function DUF205  50.47 
 
 
217 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2057  membrane protein  54.63 
 
 
210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2099  membrane protein  47.26 
 
 
203 aa  158  7e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  45.75 
 
 
198 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  47.21 
 
 
200 aa  156  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  45.28 
 
 
198 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  50.95 
 
 
205 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14881  membrane protein  43.06 
 
 
198 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  42.23 
 
 
197 aa  141  7e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  42.03 
 
 
197 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13811  membrane protein  40.95 
 
 
206 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  42.23 
 
 
197 aa  138  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  38.54 
 
 
203 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  39.91 
 
 
198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.79 
 
 
194 aa  124  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0924  hypothetical protein  38.97 
 
 
202 aa  121  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190869  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  37.13 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1406  protein of unknown function DUF205  41.9 
 
 
200 aa  119  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.55 
 
 
198 aa  118  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1509  hypothetical protein  42.65 
 
 
215 aa  118  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  42.44 
 
 
192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  43.41 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1415  hypothetical protein  38.97 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.06877  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1442  hypothetical protein  38.97 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  38.24 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  42.08 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.95 
 
 
198 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.95 
 
 
198 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  42.08 
 
 
193 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0829  protein of unknown function DUF205  38.43 
 
 
220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.46 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.19 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  39.52 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.67 
 
 
198 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.67 
 
 
198 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.46 
 
 
198 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  42.31 
 
 
195 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  41.2 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.26 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.26 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0417  hypothetical protein  38.16 
 
 
210 aa  112  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.032273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3380  membrane protein  35.92 
 
 
195 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000102812  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  37.02 
 
 
195 aa  111  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  41.23 
 
 
214 aa  111  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2579  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.89 
 
 
197 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1396  membrane protein  41.04 
 
 
216 aa  111  9e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.98 
 
 
198 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.02 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1178  hypothetical protein  40 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  37.8 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3095  protein of unknown function DUF205  41.75 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0484205  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.61 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1205  membrane protein  40.65 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  42.16 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  39.61 
 
 
201 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.61 
 
 
201 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0752  protein of unknown function DUF205  38.16 
 
 
202 aa  109  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0155  protein of unknown function DUF205  41.04 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.337449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  39.9 
 
 
210 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.78 
 
 
200 aa  108  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  38.39 
 
 
216 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  37.25 
 
 
203 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  34.2 
 
 
235 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1023  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40 
 
 
219 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0416412  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2130  protein of unknown function DUF205  38.1 
 
 
212 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.183332  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  41.35 
 
 
198 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3906  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.6 
 
 
203 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.676022  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2470  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.2 
 
 
205 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3089  hypothetical protein  40.13 
 
 
196 aa  105  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.286384  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2553  hypothetical protein  41.55 
 
 
194 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  35.29 
 
 
196 aa  105  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6513  protein of unknown function DUF205  39.61 
 
 
217 aa  104  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00773794  normal  0.103654 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2816  membrane protein  34.78 
 
 
235 aa  104  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0917  protein of unknown function DUF205  35.78 
 
 
191 aa  103  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2417  membrane protein  34.91 
 
 
235 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2175  membrane protein  34.91 
 
 
235 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0040  hypothetical protein  40.29 
 
 
197 aa  102  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2113  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.58 
 
 
199 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0796  protein of unknown function DUF205  39.15 
 
 
214 aa  102  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348496  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  35.12 
 
 
196 aa  102  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1160  protein of unknown function DUF205  35.29 
 
 
201 aa  102  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1269  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.38 
 
 
231 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.747048  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0517  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.98 
 
 
202 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0870487  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2025  membrane protein  33.91 
 
 
234 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  38.21 
 
 
224 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.71 
 
 
203 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  34.74 
 
 
216 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10540  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.55 
 
 
208 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4194  membrane protein  36.11 
 
 
201 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  42.44 
 
 
198 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  36.71 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>