More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1178 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1178  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  415  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1205  membrane protein  98.15 
 
 
216 aa  411  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1396  membrane protein  94.91 
 
 
216 aa  403  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  41.95 
 
 
198 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  40.85 
 
 
203 aa  141  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  39.72 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  40.48 
 
 
198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1406  protein of unknown function DUF205  39.05 
 
 
200 aa  128  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  44.5 
 
 
200 aa  128  8.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  36.79 
 
 
197 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  44.44 
 
 
198 aa  126  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  39.81 
 
 
200 aa  124  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  36.32 
 
 
197 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  36.54 
 
 
200 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  36.19 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2907  membrane protein  37.44 
 
 
226 aa  118  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000899467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2827  protein of unknown function DUF205  36.79 
 
 
217 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3272  protein of unknown function DUF205  36.79 
 
 
217 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14881  membrane protein  36.32 
 
 
198 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2470  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.02 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1160  protein of unknown function DUF205  38.21 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.32 
 
 
203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  39.05 
 
 
204 aa  116  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1111  hypothetical protein  38.39 
 
 
212 aa  116  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  35.85 
 
 
198 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  40.95 
 
 
214 aa  115  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  35.38 
 
 
198 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3050  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.56 
 
 
228 aa  114  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.05 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4413  hypothetical protein  37.62 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  36.67 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  38.39 
 
 
195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.1 
 
 
215 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10540  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.69 
 
 
208 aa  111  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0247  protein of unknown function DUF205  40.58 
 
 
222 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.491401 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.95 
 
 
196 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2099  membrane protein  41.29 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0752  protein of unknown function DUF205  35.38 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1955  membrane protein  40 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0878963  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1778  membrane protein  37.96 
 
 
219 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0375425 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0924  membrane protein  38.92 
 
 
205 aa  108  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.89 
 
 
197 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.44 
 
 
201 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1199  protein of unknown function DUF205  33.49 
 
 
215 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1290  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.96 
 
 
203 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0027  membrane protein  35.12 
 
 
195 aa  107  1e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  35.55 
 
 
195 aa  107  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0827  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.49 
 
 
210 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0696875  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  37.14 
 
 
198 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6513  protein of unknown function DUF205  36.54 
 
 
217 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00773794  normal  0.103654 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1357  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.81 
 
 
203 aa  106  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3570  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.62 
 
 
211 aa  106  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0795951  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3411  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.09 
 
 
211 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0338117  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0299  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.97 
 
 
216 aa  105  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017898  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0638  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.97 
 
 
216 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0557  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.97 
 
 
216 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000206924  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3274  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.48 
 
 
216 aa  105  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1109  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.5 
 
 
203 aa  105  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000633116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1269  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.09 
 
 
231 aa  105  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.747048  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0829  protein of unknown function DUF205  33.94 
 
 
220 aa  104  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.89 
 
 
198 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2057  membrane protein  37.38 
 
 
210 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0793  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.55 
 
 
213 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.414497  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2903  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.57 
 
 
203 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000317667  normal  0.0212872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2985  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.57 
 
 
203 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000527205  normal  0.538474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  33.65 
 
 
216 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  37.14 
 
 
196 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.41 
 
 
198 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0964  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.26 
 
 
190 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102328  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3095  protein of unknown function DUF205  37.91 
 
 
203 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0484205  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.45 
 
 
197 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1509  hypothetical protein  38.65 
 
 
215 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  40.47 
 
 
205 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1001  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.15 
 
 
203 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0144207  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  36.71 
 
 
193 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1415  hypothetical protein  35.78 
 
 
202 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.06877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.09 
 
 
198 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1442  hypothetical protein  35.78 
 
 
202 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2260  hypothetical protein  35.05 
 
 
226 aa  102  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  38.28 
 
 
192 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  36.49 
 
 
210 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.41 
 
 
198 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.62 
 
 
201 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3030  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.86 
 
 
196 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  37.62 
 
 
201 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0917  protein of unknown function DUF205  36.59 
 
 
191 aa  102  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  37.2 
 
 
193 aa  101  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.41 
 
 
198 aa  101  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.41 
 
 
198 aa  101  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1357  membrane protein  42.42 
 
 
232 aa  101  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  37.68 
 
 
203 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0172  membrane protein  35.24 
 
 
200 aa  101  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1077  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.7 
 
 
200 aa  101  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.116934  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  36.5 
 
 
194 aa  101  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0924  hypothetical protein  33.8 
 
 
202 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.92 
 
 
198 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2025  membrane protein  33.33 
 
 
234 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.92 
 
 
198 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3462  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.44 
 
 
203 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000897575  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3082  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.11 
 
 
203 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000753996  hitchhiker  0.0000265088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>