More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0104 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0104  membrane protein  100 
 
 
223 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1944  membrane protein  62.21 
 
 
242 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0172  membrane protein  64.43 
 
 
200 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0178  membrane protein  58.85 
 
 
327 aa  252  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.945445  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2284  protein of unknown function DUF205  59.16 
 
 
196 aa  206  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3022  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.6 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  43.01 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  42.11 
 
 
194 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.18 
 
 
200 aa  132  5e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  40.1 
 
 
193 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  47.64 
 
 
198 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  43.23 
 
 
194 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  35.03 
 
 
195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  39.06 
 
 
193 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2278  hypothetical protein  35.5 
 
 
277 aa  125  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2305  hypothetical protein  40 
 
 
277 aa  124  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  37.86 
 
 
207 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  41.67 
 
 
194 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1043  hypothetical protein  36.87 
 
 
200 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000725883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  39.09 
 
 
204 aa  121  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03451  membrane protein  36.27 
 
 
193 aa  121  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0051  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.37 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00859928  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  41.05 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  38.59 
 
 
196 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  35.61 
 
 
203 aa  118  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.24 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  42.39 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  39.59 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0796  protein of unknown function DUF205  38.25 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348496  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  38.62 
 
 
195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  40.21 
 
 
198 aa  115  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2693  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.7 
 
 
193 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00164513  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001618  acyl-phosphate:glycerol-3-phosphate O-acyltransferase PlsY  36.32 
 
 
203 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0411697  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  40.43 
 
 
196 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4339  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.55 
 
 
196 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0793  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.27 
 
 
213 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.414497  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1323  hypothetical membrane spanning protein  36.98 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.143303  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1382  hypothetical protein  36.98 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36 
 
 
215 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1077  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.45 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.116934  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  37.56 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.19 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.69 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1811  hypothetical protein  36.82 
 
 
209 aa  109  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443893  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  41.21 
 
 
219 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.69 
 
 
198 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.69 
 
 
198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.69 
 
 
198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.69 
 
 
198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0827  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.15 
 
 
210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0696875  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02929  hypothetical protein  38.78 
 
 
205 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0641  protein of unknown function DUF205  38.78 
 
 
205 aa  108  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3522  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.78 
 
 
205 aa  108  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.143249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.69 
 
 
198 aa  108  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02879  hypothetical protein  38.78 
 
 
205 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00143193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.19 
 
 
198 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0640  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.78 
 
 
205 aa  108  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000218346  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3237  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.78 
 
 
205 aa  108  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.400213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.19 
 
 
198 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4371  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.78 
 
 
205 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.69 
 
 
198 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3352  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.78 
 
 
205 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.187945  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3490  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.78 
 
 
205 aa  108  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.7848  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1851  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.66 
 
 
226 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3393  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.44 
 
 
203 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000138608  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3467  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.44 
 
 
203 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.088969  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.31 
 
 
198 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4296  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.86 
 
 
212 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0033487  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3563  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.44 
 
 
203 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.299047  normal  0.098829 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3461  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.44 
 
 
203 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0949629  normal  0.0662148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3397  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.44 
 
 
205 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0827634  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  40 
 
 
200 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0299  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.38 
 
 
216 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017898  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  36.41 
 
 
216 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0638  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.38 
 
 
216 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0557  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.38 
 
 
216 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000206924  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0740  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.71 
 
 
212 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3809  hypothetical protein  41.79 
 
 
203 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4194  membrane protein  40.1 
 
 
201 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2329  hypothetical protein  39.49 
 
 
197 aa  106  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2470  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.11 
 
 
205 aa  105  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1001  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.82 
 
 
203 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0144207  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0829  protein of unknown function DUF205  33.64 
 
 
220 aa  105  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3411  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.17 
 
 
211 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0338117  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  35.48 
 
 
226 aa  104  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1158  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.11 
 
 
202 aa  104  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000140033  normal  0.0384563 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  38.46 
 
 
198 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  37.31 
 
 
192 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  35.79 
 
 
197 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3570  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  31.92 
 
 
211 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0795951  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1111  hypothetical protein  35.47 
 
 
212 aa  104  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3272  protein of unknown function DUF205  39.41 
 
 
217 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2827  protein of unknown function DUF205  39.41 
 
 
217 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  37.95 
 
 
198 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0982  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.75 
 
 
203 aa  102  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00892107  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1594  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37 
 
 
212 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22068  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0171  hypothetical protein  32.46 
 
 
198 aa  102  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0917  protein of unknown function DUF205  35.08 
 
 
191 aa  102  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1155  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.37 
 
 
212 aa  101  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327408  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  35.79 
 
 
197 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>