More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0125 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0125  protein of unknown function DUF205  100 
 
 
198 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.765264  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0125  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0040  hypothetical protein  55.98 
 
 
197 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  55.26 
 
 
203 aa  191  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1811  hypothetical protein  47.96 
 
 
209 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443893  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2521  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.75 
 
 
203 aa  171  9e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.635021 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  49.73 
 
 
210 aa  168  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2382  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  52.15 
 
 
200 aa  166  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.332777 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2989  hypothetical protein  52.72 
 
 
198 aa  165  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0575  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50.27 
 
 
202 aa  164  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0320  protein of unknown function DUF205  49.25 
 
 
208 aa  164  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.254648  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5145  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50 
 
 
189 aa  164  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0740  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.17 
 
 
212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2546  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  51.91 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0155  protein of unknown function DUF205  51.38 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.337449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4637  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  52.2 
 
 
192 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1158  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.91 
 
 
202 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000140033  normal  0.0384563 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1001  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.73 
 
 
203 aa  160  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0144207  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  49.74 
 
 
226 aa  160  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0293  hypothetical protein  46.81 
 
 
210 aa  159  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0724  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50.55 
 
 
189 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07580  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50.55 
 
 
189 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0346741 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1109  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.15 
 
 
203 aa  158  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000633116  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2329  hypothetical protein  49.21 
 
 
197 aa  158  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2327  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  56.99 
 
 
196 aa  158  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  0.01581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5888  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  49.74 
 
 
212 aa  158  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  47.89 
 
 
224 aa  157  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0753  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  52.17 
 
 
214 aa  157  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1290  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.15 
 
 
203 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2823  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50.82 
 
 
207 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.571241 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2580  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  53.55 
 
 
208 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2417  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50.27 
 
 
207 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0517  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.9 
 
 
202 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0870487  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1077  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.39 
 
 
200 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.116934  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1945  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  53.55 
 
 
213 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2903  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.64 
 
 
203 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000317667  normal  0.0212872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2985  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.64 
 
 
203 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000527205  normal  0.538474 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2556  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  53.55 
 
 
213 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477971  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0391  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50.57 
 
 
189 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566862  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3209  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  51.63 
 
 
214 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468969  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2604  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  54.95 
 
 
212 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1851  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.44 
 
 
226 aa  155  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4024  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  53.85 
 
 
192 aa  155  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2243  protein of unknown function DUF205  49.46 
 
 
211 aa  155  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.341308  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3082  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.64 
 
 
203 aa  155  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000753996  hitchhiker  0.0000265088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0425  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50 
 
 
189 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.954266  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0533  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.04 
 
 
198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2475  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  54.14 
 
 
212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0301507 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2753  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.46 
 
 
206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0964  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.79 
 
 
190 aa  154  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102328  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1594  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.47 
 
 
212 aa  154  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22068  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0541  hypothetical protein  50.55 
 
 
192 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2305  hypothetical protein  44.62 
 
 
277 aa  153  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2278  hypothetical protein  44.62 
 
 
277 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  45.83 
 
 
195 aa  153  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2062  hypothetical protein  47.96 
 
 
202 aa  153  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2829  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.33 
 
 
204 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000278679  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50 
 
 
189 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.134868  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1382  hypothetical protein  47.54 
 
 
193 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1323  hypothetical membrane spanning protein  47.54 
 
 
193 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.143303  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  46.39 
 
 
194 aa  152  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4339  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.39 
 
 
196 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0051  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.55 
 
 
208 aa  149  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00859928  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  47.09 
 
 
216 aa  149  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  50.54 
 
 
210 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1070  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  51.09 
 
 
203 aa  148  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1193  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.26 
 
 
203 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00378287  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1149  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.26 
 
 
203 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000383384  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0914  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  51.09 
 
 
203 aa  148  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1226  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.26 
 
 
203 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018148  normal  0.553858 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0918  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  51.09 
 
 
203 aa  148  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3164  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.26 
 
 
203 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.226003  normal  0.246381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  43.81 
 
 
193 aa  148  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0121  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50.54 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0372  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50.54 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2507  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50.54 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0672  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50.54 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1043  hypothetical protein  44.15 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000725883  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.54 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001618  acyl-phosphate:glycerol-3-phosphate O-acyltransferase PlsY  46.99 
 
 
203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0411697  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4811  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  49.43 
 
 
189 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575217  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  42.78 
 
 
193 aa  144  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0828  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.03 
 
 
195 aa  144  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00106663  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  51.08 
 
 
201 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3467  hypothetical protein  49.73 
 
 
213 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  51.08 
 
 
201 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0729  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  49.46 
 
 
202 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02929  hypothetical protein  46.56 
 
 
205 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0641  protein of unknown function DUF205  46.56 
 
 
205 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3522  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.56 
 
 
205 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.143249  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3411  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.04 
 
 
211 aa  142  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0338117  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02879  hypothetical protein  46.56 
 
 
205 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00143193  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0640  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.56 
 
 
205 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000218346  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3237  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.56 
 
 
205 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.400213  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3490  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.56 
 
 
205 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.7848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4371  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.56 
 
 
205 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3352  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.56 
 
 
205 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.187945  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0827  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.11 
 
 
210 aa  142  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0696875  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3397  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.49 
 
 
205 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0827634  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3563  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.49 
 
 
203 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.299047  normal  0.098829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>