More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3856 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3856  protein of unknown function DUF205  100 
 
 		 204 aa  391  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0565232 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  56.12 
 
 		 201 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  56.65 
 
 		 196 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  57.58 
 
 		 196 aa  197  7e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3030  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  58.21 
 
 		 196 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  58.71 
 
 		 197 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  56.63 
 
 		 203 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0566  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  58.16 
 
 		 201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0601  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  58.16 
 
 		 201 aa  194  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  56.65 
 
 		 214 aa  194  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4727  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  56.85 
 
 		 198 aa  192  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3529  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  58.71 
 
 		 203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.536272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1357  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  57.14 
 
 		 203 aa  187  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2284  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  57 
 
 		 198 aa  187  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.278877  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  54.27 
 
 		 210 aa  184  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2553  hypothetical protein  54.27 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  54.73 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  54.73 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3314  hypothetical protein  58.29 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3514  protein of unknown function DUF205  57.71 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3637  protein of unknown function DUF205  57.29 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.646526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0473  hypothetical protein  58.67 
 
 		 201 aa  174  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537999  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3420  hypothetical protein  57.35 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296095  normal  0.610432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1760  hypothetical protein  55.33 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3095  protein of unknown function DUF205  51.31 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0484205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1715  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  52.85 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.23261  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1297  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  53.57 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114938  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1208  hypothetical protein  54.69 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1389  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  52.55 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.942836  normal  0.154079 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3073  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  56.48 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1643  protein of unknown function DUF205  52.55 
 
 		 212 aa  154  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3192  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  56.1 
 
 		 216 aa  154  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1509  hypothetical protein  51.72 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3906  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  55.79 
 
 		 203 aa  152  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.676022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1800  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  54.73 
 
 		 197 aa  151  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428645  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  46.46 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  47.09 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0027  membrane protein  38.12 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3917  hypothetical protein  56.06 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.83 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4346  hypothetical protein  58.73 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  46.08 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1594  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.12 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.99 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0007  membrane protein  40.21 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.386788  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2062  hypothetical protein  47.15 
 
 		 202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.62 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  41.95 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2382  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.79 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.332777 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  42.86 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  45.13 
 
 		 195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  44.04 
 
 		 194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0533  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.96 
 
 		 198 aa  128  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1811  hypothetical protein  40.51 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443893  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2546  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.62 
 
 		 207 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  46.77 
 
 		 193 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3312  protein of unknown function DUF205  60.11 
 
 		 200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0040  hypothetical protein  43.2 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1851  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.05 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0517  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40 
 
 		 202 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0870487  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0575  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.08 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2329  hypothetical protein  43.14 
 
 		 197 aa  125  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2823  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.23 
 
 		 207 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.571241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0740  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.63 
 
 		 212 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  41.18 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1070  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.06 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0918  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.06 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4194  membrane protein  44.16 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  45.27 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0914  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.06 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3467  hypothetical protein  45 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0293  hypothetical protein  42.35 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2417  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.23 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0155  protein of unknown function DUF205  43.72 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.337449 
 
 
-
 
NC_002978  WD1045  membrane protein  41.92 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0514338  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0672  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.56 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0372  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.56 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2507  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.56 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0121  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.56 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3209  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.33 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0729  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.06 
 
 		 202 aa  121  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  42.23 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2243  protein of unknown function DUF205  40.72 
 
 		 211 aa  121  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.341308  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0753  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.1 
 
 		 214 aa  120  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2753  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.72 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5888  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.33 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2475  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.35 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0301507 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4637  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.86 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2907  membrane protein  42.08 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000899467 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  43.08 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2604  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.35 
 
 		 212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0247  protein of unknown function DUF205  41.84 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.491401 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1001  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.61 
 
 		 203 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0144207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2586  hypothetical protein  45.59 
 
 		 263 aa  117  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140764 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  42.94 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0638  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.69 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0299  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.69 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0557  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.69 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000206924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  38.14 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2989  hypothetical protein  44.9 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>