More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0924 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0924  membrane protein  100 
 
 
205 aa  411  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0813  membrane protein  60.96 
 
 
200 aa  239  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.979835  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1616  hypothetical protein  46.56 
 
 
202 aa  165  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  45.79 
 
 
196 aa  150  8.999999999999999e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  46.07 
 
 
196 aa  150  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  43.09 
 
 
192 aa  142  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  42.86 
 
 
200 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  43.17 
 
 
198 aa  132  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  39.78 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  42.47 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  40.11 
 
 
194 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2815  protein of unknown function DUF205  41.81 
 
 
205 aa  126  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.25 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10540  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.89 
 
 
208 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  37.7 
 
 
195 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  38.38 
 
 
195 aa  123  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  39.23 
 
 
200 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.32 
 
 
201 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2907  membrane protein  38.31 
 
 
226 aa  121  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000899467 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  37.84 
 
 
204 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2470  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.9 
 
 
205 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  41.53 
 
 
195 aa  119  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.53 
 
 
196 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1406  protein of unknown function DUF205  37.11 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0240  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.5 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  38.25 
 
 
210 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  34.76 
 
 
198 aa  115  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  37.5 
 
 
194 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  36.93 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  36.36 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  36.79 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  36.6 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1025  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.81 
 
 
207 aa  112  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.942008  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  36.76 
 
 
197 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0729  protein of unknown function DUF205  34.42 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.382163  normal  0.327374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2260  hypothetical protein  36.82 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.43 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  37.36 
 
 
193 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1001  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.33 
 
 
203 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0144207  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.5 
 
 
215 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0752  protein of unknown function DUF205  38.25 
 
 
202 aa  111  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1158  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.11 
 
 
202 aa  112  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000140033  normal  0.0384563 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3380  membrane protein  36.56 
 
 
195 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000102812  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.25 
 
 
201 aa  111  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  36.22 
 
 
197 aa  111  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  38.25 
 
 
201 aa  111  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1357  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40 
 
 
203 aa  111  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0917  protein of unknown function DUF205  40.53 
 
 
191 aa  111  9e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4413  hypothetical protein  41.58 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.07 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0027  membrane protein  34.92 
 
 
195 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2389  hypothetical protein  34.72 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000658646  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2827  protein of unknown function DUF205  34.87 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3272  protein of unknown function DUF205  34.87 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1396  membrane protein  39.41 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1045  membrane protein  37.63 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0514338  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2175  membrane protein  36.65 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  35.56 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  36.98 
 
 
194 aa  109  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2443  membrane protein  35.75 
 
 
235 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14881  membrane protein  34.01 
 
 
198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  35.44 
 
 
216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  38.17 
 
 
198 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1178  hypothetical protein  38.92 
 
 
216 aa  108  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1205  membrane protein  38.92 
 
 
216 aa  108  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1389  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.41 
 
 
206 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.942836  normal  0.154079 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1077  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.68 
 
 
200 aa  108  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.116934  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  38.17 
 
 
198 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2113  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.81 
 
 
199 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1290  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.24 
 
 
203 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2903  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.24 
 
 
203 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000317667  normal  0.0212872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2985  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.24 
 
 
203 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000527205  normal  0.538474 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  38.22 
 
 
196 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1187  protein of unknown function DUF205  37.23 
 
 
196 aa  107  9.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000281015  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.36 
 
 
203 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3082  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.7 
 
 
203 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000753996  hitchhiker  0.0000265088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5145  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.92 
 
 
189 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3030  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.36 
 
 
196 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.26 
 
 
198 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1109  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.7 
 
 
203 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000633116  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  35.68 
 
 
207 aa  105  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.68 
 
 
197 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0601  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.97 
 
 
201 aa  105  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1160  protein of unknown function DUF205  37.77 
 
 
201 aa  105  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2099  membrane protein  36.16 
 
 
203 aa  105  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1715  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.89 
 
 
216 aa  105  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.23261  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.17 
 
 
197 aa  104  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  33.68 
 
 
211 aa  104  9e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2693  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.81 
 
 
193 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00164513  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1643  protein of unknown function DUF205  34.39 
 
 
212 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1297  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.96 
 
 
206 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114938  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0964  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.41 
 
 
190 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.87 
 
 
198 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0566  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.97 
 
 
201 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.33 
 
 
198 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.68 
 
 
196 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4194  membrane protein  38.83 
 
 
201 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.48 
 
 
198 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4637  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.33 
 
 
192 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.48 
 
 
198 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>