More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5119 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  100 
 
 		 240 aa  497  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  46.4 
 
 		 248 aa  198  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  41.25 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  40.59 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  36.63 
 
 		 236 aa  168  8e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  40.74 
 
 		 243 aa  166  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  37.66 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  38.82 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  38.91 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  39.32 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  39.26 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  40.17 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  38.68 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.68 
 
 		 245 aa  161  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  38.68 
 
 		 245 aa  161  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  38.68 
 
 		 245 aa  161  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  38.68 
 
 		 245 aa  161  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  38.68 
 
 		 245 aa  161  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  38.68 
 
 		 245 aa  161  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  38.68 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  38.27 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  36.1 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  36.1 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  36.1 
 
 		 252 aa  158  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  41.36 
 
 		 215 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  38.49 
 
 		 248 aa  151  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  36.97 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  36.97 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  36.97 
 
 		 238 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  36.97 
 
 		 238 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  36.93 
 
 		 238 aa  148  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  35.15 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  35.2 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  33.06 
 
 		 248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  36.29 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  37.45 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  36.48 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  33.2 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  37.04 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  35.85 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  37.19 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  33.46 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  37.19 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  34.57 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  35.74 
 
 		 255 aa  138  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  34.44 
 
 		 238 aa  138  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  32.95 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  32.82 
 
 		 263 aa  135  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  34.44 
 
 		 241 aa  129  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  34.82 
 
 		 220 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  34.75 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  25.33 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  23.61 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  24.19 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  30.77 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  23.08 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  24.14 
 
 		 211 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  24.76 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1358  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.04 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.776581  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  22.07 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  25.61 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  23.14 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  24.35 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.05 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  22.73 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  28.08 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  26.09 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0822  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.58 
 
 		 306 aa  68.6  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.608394  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  23.79 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0905  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.04 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  27.35 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  23.22 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  30.64 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.32 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  normal  0.149548 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1173  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.93 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404296  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  34.48 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  23.53 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  30.66 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  34.48 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  26.38 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3142  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.77 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.764065  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  24.24 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  24.54 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  27.7 
 
 		 246 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  27.7 
 
 		 246 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.72 
 
 		 302 aa  62  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  26.62 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  26.62 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  26.62 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  26.62 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.59 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  26.62 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  21.05 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2470  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.65 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112991  hitchhiker  0.0000511944 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  25.44 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  29.79 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  29.79 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1667  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.65 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1352  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.05 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>