32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1970 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1970  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 260 aa  535  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3370  protein of unknown function DUF1080  69.58 
 
 		 263 aa  361  6e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2684  hypothetical protein  34.52 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3234  protein of unknown function DUF1080  31.62 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0676  protein of unknown function DUF1080  30.34 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00436  putative multi-domain protein  32.74 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0594334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4771  protein of unknown function DUF1080  29.67 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1623  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  35.06 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5826  protein of unknown function DUF1080  31.84 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.515492  normal  0.0752665 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3796  protein of unknown function DUF1080  33.94 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.537243  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1044  protein of unknown function DUF1080  33.14 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0038  protein of unknown function DUF1080  28.95 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3945  protein of unknown function DUF1080  30.2 
 
 		 540 aa  67.8  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  30.17 
 
 		 786 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4614  hypothetical protein  32.39 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  31.61 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2130  protein of unknown function DUF1080  27.64 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0703426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  28.72 
 
 		 482 aa  65.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3044  hypothetical protein  30.65 
 
 		 352 aa  65.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  25.75 
 
 		 1145 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  28.1 
 
 		 321 aa  52.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  26.04 
 
 		 1140 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  26.63 
 
 		 629 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.985217 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  30 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  27.01 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  26.15 
 
 		 478 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3235  protein of unknown function DUF1080  23.28 
 
 		 595 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0080488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  25.82 
 
 		 628 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  26.67 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  28.74 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  27.78 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>