135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1338 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  100 
 
 		 173 aa  354  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  63.74 
 
 		 171 aa  219  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  61.05 
 
 		 171 aa  213  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  59.77 
 
 		 175 aa  205  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  54.29 
 
 		 176 aa  197  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  53.3 
 
 		 183 aa  183  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  57.14 
 
 		 173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  50.57 
 
 		 175 aa  180  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  48.26 
 
 		 172 aa  172  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  52.02 
 
 		 172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  47.09 
 
 		 168 aa  170  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  48.62 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  48.55 
 
 		 169 aa  167  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  48.95 
 
 		 189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  51.15 
 
 		 165 aa  164  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  48.42 
 
 		 189 aa  164  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  45.71 
 
 		 176 aa  160  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  47.75 
 
 		 179 aa  160  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  50.29 
 
 		 176 aa  160  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  43.18 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  42.77 
 
 		 174 aa  158  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  47.67 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  52.22 
 
 		 173 aa  158  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  44.25 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  45.95 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  45.61 
 
 		 195 aa  155  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  45.35 
 
 		 163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  46.24 
 
 		 169 aa  153  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  45.24 
 
 		 199 aa  152  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  44.13 
 
 		 179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  45.6 
 
 		 181 aa  151  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  42.93 
 
 		 182 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  44 
 
 		 180 aa  150  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  47.7 
 
 		 173 aa  150  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2454  phage tail Collar  51.74 
 
 		 165 aa  150  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.45663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  43.83 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  46.63 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  40.68 
 
 		 178 aa  148  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  42.77 
 
 		 172 aa  147  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  44.77 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  45.25 
 
 		 180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  41.36 
 
 		 192 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  43.2 
 
 		 170 aa  145  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  39.11 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  43.86 
 
 		 173 aa  144  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  41.44 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  41.71 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  40.4 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  44.86 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  42.86 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  47.37 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  39.9 
 
 		 199 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  45.45 
 
 		 173 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  39.9 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  41.53 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  43.6 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  41.75 
 
 		 195 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  45.14 
 
 		 175 aa  137  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  42.13 
 
 		 179 aa  137  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  41.76 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  46.51 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  40.91 
 
 		 176 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  41.41 
 
 		 196 aa  134  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  37.57 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  43.43 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03559  microcystin dependent protein  42.29 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.536453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  39.44 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  40.32 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  41.48 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  40 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  40.33 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  37.91 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  41.36 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  39.01 
 
 		 181 aa  127  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  39.11 
 
 		 205 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  38 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  40.62 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  39.23 
 
 		 180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  36.68 
 
 		 195 aa  116  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  38.86 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6119  Tail Collar domain protein  41.76 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  32.52 
 
 		 206 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4046  phage tail collar domain-containing protein  41.81 
 
 		 179 aa  103  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  35.71 
 
 		 211 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  44.9 
 
 		 210 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  29.23 
 
 		 196 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  33.5 
 
 		 207 aa  95.9  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4048  phage tail collar domain-containing protein  39.55 
 
 		 179 aa  94.4  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4722  phage tail collar domain-containing protein  65.57 
 
 		 80 aa  91.7  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  61.29 
 
 		 80 aa  88.2  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0053  phage tail collar domain-containing protein  42.71 
 
 		 209 aa  87.8  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2491  Tail Collar domain protein  58.06 
 
 		 80 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  42.27 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2124  Tail Collar domain protein  56.72 
 
 		 84 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0754  phage tail collar domain-containing protein  53.23 
 
 		 80 aa  79  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  30.54 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2343  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 80 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.607801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  34.44 
 
 		 264 aa  74.3  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2887  Tail Collar domain protein  47.46 
 
 		 80 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00705187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2884  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000266476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>