234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1078 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  100 
 
 
310 aa  629  1e-179  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  91.96 
 
 
311 aa  589  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  88.75 
 
 
311 aa  569  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  41.37 
 
 
279 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  41.01 
 
 
279 aa  228  9e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  42.65 
 
 
279 aa  226  3e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  40.65 
 
 
279 aa  226  4e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  42.24 
 
 
279 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  43.73 
 
 
279 aa  223  4e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  35.51 
 
 
280 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  34.78 
 
 
280 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  34.3 
 
 
279 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  34.06 
 
 
281 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  33.94 
 
 
279 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  35.74 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  34.89 
 
 
282 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  35.02 
 
 
281 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  31.77 
 
 
279 aa  169  7e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  33.69 
 
 
279 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  34.3 
 
 
282 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  32.85 
 
 
282 aa  165  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  34.07 
 
 
276 aa  159  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  35.02 
 
 
282 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  31.43 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  31.9 
 
 
293 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  31.56 
 
 
280 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  33.45 
 
 
282 aa  143  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  30.6 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  31.45 
 
 
280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  31.65 
 
 
286 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  31.65 
 
 
286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3640  degV family protein  30.8 
 
 
284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00084182  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  30.4 
 
 
280 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  32.62 
 
 
286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  31.65 
 
 
286 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  30.28 
 
 
287 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  32.26 
 
 
286 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  33.22 
 
 
282 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  32.62 
 
 
286 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  32.26 
 
 
286 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  32.26 
 
 
286 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  32.26 
 
 
286 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  31.9 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  32.36 
 
 
287 aa  136  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  29.82 
 
 
285 aa  136  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  33.1 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  31.09 
 
 
277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  30.14 
 
 
285 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1644  degV family protein  29.93 
 
 
604 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.524877  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0150  degV family protein  31.14 
 
 
833 aa  129  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  27.46 
 
 
287 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  29.45 
 
 
281 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  29.41 
 
 
312 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  30.36 
 
 
281 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1032  degV family protein  29.47 
 
 
284 aa  124  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.185654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  28.42 
 
 
279 aa  123  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  30.28 
 
 
286 aa  123  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  29.78 
 
 
293 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  27.93 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  30.58 
 
 
286 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  27.54 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  28.42 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  30.39 
 
 
637 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  27.9 
 
 
280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  28.17 
 
 
279 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  31.05 
 
 
271 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  28.73 
 
 
281 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  28.17 
 
 
279 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0171  DegV family protein  30.29 
 
 
276 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  29.08 
 
 
286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  30.25 
 
 
284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  29.86 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  29.72 
 
 
290 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  28.06 
 
 
280 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  29.82 
 
 
281 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  29.68 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  29.04 
 
 
281 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  28.78 
 
 
287 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  29.3 
 
 
284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0600  degV family protein  29.14 
 
 
683 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100467 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  28.42 
 
 
287 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  28.42 
 
 
287 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  28.42 
 
 
280 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  28.42 
 
 
280 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  27.64 
 
 
282 aa  115  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_903  DegV  27.3 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00149031  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  31.77 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  32.43 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  26.81 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  28.06 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  26.81 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  28.88 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  28.93 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1185  hypothetical protein  29.56 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  27.17 
 
 
280 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  28.33 
 
 
299 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  27.34 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  27.17 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  27.17 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  27.17 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>