More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2061 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2061  Acyl transferase  100 
 
 		 1420 aa  2857    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.206249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  30.23 
 
 		 2327 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  31.52 
 
 		 4478 aa  127  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  27.53 
 
 		 2754 aa  127  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  30.53 
 
 		 3252 aa  124  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  29.41 
 
 		 1656 aa  121  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  31.33 
 
 		 1548 aa  121  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  28.41 
 
 		 2414 aa  118  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  29.11 
 
 		 1909 aa  117  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0665  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.65 
 
 		 306 aa  116  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0426471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  28.67 
 
 		 2551 aa  115  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  27.78 
 
 		 2619 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.87 
 
 		 1816 aa  114  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  31.82 
 
 		 2386 aa  113  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  23.34 
 
 		 2300 aa  113  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10280  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  28.82 
 
 		 309 aa  113  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0189442  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  28.83 
 
 		 3158 aa  112  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  34.15 
 
 		 2880 aa  112  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 5154 aa  112  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  27.35 
 
 		 3008 aa  112  7.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  27.94 
 
 		 3645 aa  112  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  25.15 
 
 		 1272 aa  111  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0221  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.77 
 
 		 343 aa  111  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.65 
 
 		 1874 aa  110  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  28.81 
 
 		 3281 aa  110  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0641  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  30.72 
 
 		 313 aa  110  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000153814  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0952  Beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 		 2485 aa  110  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  27.98 
 
 		 2298 aa  109  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0128  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  27.02 
 
 		 293 aa  109  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199952  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  28.1 
 
 		 3045 aa  109  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0130  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  27.02 
 
 		 293 aa  109  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0176  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.45 
 
 		 304 aa  108  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1034  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  28.52 
 
 		 291 aa  108  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.24557  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.36 
 
 		 2551 aa  108  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  26.85 
 
 		 1349 aa  108  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1947  Beta-ketoacyl synthase  32.27 
 
 		 2468 aa  107  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.75 
 
 		 5400 aa  108  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2223  Beta-ketoacyl synthase  32.27 
 
 		 2468 aa  107  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.75 
 
 		 1337 aa  108  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  32.05 
 
 		 2628 aa  107  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2561  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  30.5 
 
 		 304 aa  107  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  31.51 
 
 		 3424 aa  106  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0132  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.34 
 
 		 301 aa  106  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.446703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  26.17 
 
 		 1349 aa  106  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0340  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.36 
 
 		 304 aa  106  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000186128  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  27.39 
 
 		 2640 aa  106  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  29.73 
 
 		 4882 aa  106  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1838  Beta-ketoacyl synthase  31.91 
 
 		 2468 aa  106  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  26.49 
 
 		 2462 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  31.2 
 
 		 2113 aa  106  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0516  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  27.78 
 
 		 305 aa  106  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  30.56 
 
 		 2376 aa  105  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01060  (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase  31.77 
 
 		 298 aa  105  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.271896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  27.38 
 
 		 2703 aa  105  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0168  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  30.53 
 
 		 302 aa  105  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4573  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  28.52 
 
 		 321 aa  105  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124342  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  27.39 
 
 		 2624 aa  105  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  29.72 
 
 		 2374 aa  105  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0138  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.89 
 
 		 293 aa  105  7e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.488001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  25.82 
 
 		 1087 aa  105  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  27.07 
 
 		 2657 aa  105  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3100  Acyl transferase  26.71 
 
 		 866 aa  105  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2073  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.36 
 
 		 314 aa  105  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  25.66 
 
 		 2531 aa  104  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  25 
 
 		 1764 aa  104  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 		 3092 aa  104  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  26 
 
 		 1354 aa  104  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1945  Beta-ketoacyl synthase  31.25 
 
 		 2484 aa  103  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  26.34 
 
 		 2260 aa  103  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  27.44 
 
 		 2454 aa  103  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6222  beta-ketoacyl synthase  29.71 
 
 		 1304 aa  103  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  24.93 
 
 		 3099 aa  103  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1813  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.06 
 
 		 317 aa  103  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  28.79 
 
 		 7279 aa  103  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  27.09 
 
 		 2694 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0957  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.13 
 
 		 314 aa  103  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.915141  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  27.79 
 
 		 2560 aa  103  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0611  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  25.52 
 
 		 299 aa  103  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000665754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  28.87 
 
 		 1795 aa  103  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  23.81 
 
 		 2176 aa  102  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  25.87 
 
 		 1646 aa  102  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  26.98 
 
 		 2642 aa  102  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  25.96 
 
 		 1416 aa  102  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  24.32 
 
 		 1772 aa  102  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0317  Beta-ketoacyl synthase  30.92 
 
 		 2476 aa  102  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.567588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  30 
 
 		 1372 aa  102  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  27.09 
 
 		 2693 aa  102  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  28.67 
 
 		 3702 aa  102  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  28.03 
 
 		 6889 aa  101  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.21 
 
 		 7110 aa  102  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0869  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  30.48 
 
 		 326 aa  101  9e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  27.9 
 
 		 2266 aa  101  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  27.4 
 
 		 2066 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  31.33 
 
 		 4840 aa  101  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  25.58 
 
 		 2762 aa  101  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  28.67 
 
 		 3693 aa  101  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2380  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  27.21 
 
 		 423 aa  101  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  28.67 
 
 		 3693 aa  101  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  27.86 
 
 		 2750 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  29.03 
 
 		 3337 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>