64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3494 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  100 
 
 		 346 aa  714    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  72.16 
 
 		 335 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  70.66 
 
 		 420 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  60.31 
 
 		 341 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  54.47 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  49.84 
 
 		 347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  44.25 
 
 		 324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  40.38 
 
 		 351 aa  260  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  34.53 
 
 		 498 aa  156  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  36.11 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  32.99 
 
 		 500 aa  149  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  32 
 
 		 488 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  33.56 
 
 		 374 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  31.18 
 
 		 486 aa  133  6e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  33.55 
 
 		 513 aa  132  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  32.51 
 
 		 547 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  33.22 
 
 		 478 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  31.18 
 
 		 486 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  31.18 
 
 		 486 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  31.82 
 
 		 489 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  30.23 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  29.51 
 
 		 375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  30.14 
 
 		 511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  32 
 
 		 487 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  31.54 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  28.84 
 
 		 485 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  33.33 
 
 		 339 aa  123  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  31.27 
 
 		 484 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  31.9 
 
 		 487 aa  122  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  32.52 
 
 		 496 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  30.31 
 
 		 360 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  29.32 
 
 		 374 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  32.78 
 
 		 516 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  29.32 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  29.32 
 
 		 374 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  30.43 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  30 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  29.06 
 
 		 355 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  29.91 
 
 		 423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  28.21 
 
 		 487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  29.79 
 
 		 346 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  29.63 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  28.04 
 
 		 482 aa  109  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  28.16 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  27.52 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  27.4 
 
 		 497 aa  103  6e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  24.92 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  27.11 
 
 		 420 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  27.46 
 
 		 408 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  28.2 
 
 		 427 aa  90.1  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  26.79 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  26.49 
 
 		 420 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  25.99 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  27 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  25 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  25.3 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  25.93 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  23.71 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1122  phosphoesterase RecJ domain protein  30.56 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00100045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3186  phosphoesterase RecJ domain protein  23.71 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.500315  normal  0.376889 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3962  phosphoesterase RecJ domain protein  26.17 
 
 		 357 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.9 
 
 		 873 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  28.04 
 
 		 877 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1967  signal protein  27.54 
 
 		 675 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.764897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>