52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2903 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  185  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5066  plasmid stabilization system  38.46 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1683  plasmid stabilization system  41.76 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.294502  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  43.96 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  36.26 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  35.48 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  36.56 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5346  plasmid stabilization system  36.26 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.461356 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  35.48 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0699  plasmid stabilization system protein  36.26 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00627414  normal  0.782254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.97 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4447  plasmid stabilization system  34.07 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00132305  normal  0.136677 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5046  plasmid stabilization system  34.07 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1735  plasmid stabilization system  34.07 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416669  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4337  plasmid stabilization system  34.07 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17652  normal  0.215547 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  36.14 
 
 		 86 aa  52.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0093  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00661999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  34.09 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6449  plasmid stabilization system protein  35.16 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  0.305922 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0021  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.941725  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  34.44 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.67 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0480  plasmid stabilization system protein  28.42 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  33.33 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  27.78 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  28.74 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  27.59 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  31.76 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0144  plasmid stabilization system  35.37 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  31.11 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  30.68 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  27.78 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  29.21 
 
 		 91 aa  42  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  28.57 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.18 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  28.12 
 
 		 114 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  29.07 
 
 		 94 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.87 
 
 		 96 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  29.55 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2332  plasmid stabilization system protein  29.89 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.41 
 
 		 109 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  26.67 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  26.97 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.23 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  28.74 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0416  hypothetical protein  26.97 
 
 		 105 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0407  hypothetical protein  26.97 
 
 		 105 aa  40  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>