170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2330 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2330  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  822    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0440768  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1540  methyltransferase type 11  40.91 
 
 		 402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000274527  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0445  Methyltransferase type 11  40.35 
 
 		 399 aa  299  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.832039  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1320  Methyltransferase type 11  44.63 
 
 		 315 aa  286  4e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.065684 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1828  Methyltransferase type 12  39.19 
 
 		 412 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  hitchhiker  0.0000267475 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  34.86 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1822  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 213 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00574627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6034  hypothetical protein  47.13 
 
 		 211 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335724  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1120  hypothetical protein  44.13 
 
 		 217 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1270  hypothetical protein  44.77 
 
 		 217 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2718  hypothetical protein  39.88 
 
 		 217 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0525784  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0224  hypothetical protein  36.06 
 
 		 214 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0587288  normal  0.156271 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13313  predicted protein  37.8 
 
 		 229 aa  136  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27591  predicted protein  31.84 
 
 		 241 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.861459  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1009  Methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 215 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00599159  normal  0.0418085 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14191  predicted protein  34.1 
 
 		 225 aa  126  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1926  Methyltransferase type 11  35.21 
 
 		 213 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3170  methyltransferase type 11  33.76 
 
 		 219 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0295556  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1977  hypothetical protein  34.81 
 
 		 217 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.183577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3179  hypothetical protein  32.7 
 
 		 216 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2938  Methyltransferase type 11  32.7 
 
 		 216 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2053  methyltransferase type 11  33.7 
 
 		 221 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13458  predicted protein  34.27 
 
 		 207 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37443  predicted protein  30.99 
 
 		 279 aa  111  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0385962  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  35.88 
 
 		 218 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1476  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.470823 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1031  hypothetical protein  32.74 
 
 		 217 aa  104  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0256527  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4604  predicted protein  31.25 
 
 		 209 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0142714  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0525  Methyltransferase type 11  36.31 
 
 		 237 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13601  hypothetical protein  30.17 
 
 		 212 aa  99.8  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14201  hypothetical protein  32.16 
 
 		 217 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432496 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13691  hypothetical protein  29.67 
 
 		 212 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0487979  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1268  hypothetical protein  29.24 
 
 		 212 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.391733  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13391  hypothetical protein  27.47 
 
 		 214 aa  90.1  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.417782  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10751  hypothetical protein  30.77 
 
 		 215 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0372  SAM-dependent methyltransferase  28.57 
 
 		 216 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118814  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10541  hypothetical protein  27.98 
 
 		 216 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.864146  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51541  methionine-dependent methyltransferase  26.44 
 
 		 214 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  37.09 
 
 		 261 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.62 
 
 		 265 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0483  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  27.15 
 
 		 147 aa  53.1  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.670447  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.4 
 
 		 235 aa  52.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  46.15 
 
 		 283 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.61 
 
 		 287 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1427  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  21.25 
 
 		 160 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.865195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 248 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  48.89 
 
 		 240 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2415  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  28.57 
 
 		 156 aa  51.2  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580668 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 244 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  39.24 
 
 		 281 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1297  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  23.17 
 
 		 161 aa  50.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0272874  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 248 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1319  hypothetical protein  38.89 
 
 		 70 aa  50.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  45.1 
 
 		 281 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2349  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  26.9 
 
 		 166 aa  49.7  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.50784 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3417  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SlyD  28.57 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 240 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0168  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  24.84 
 
 		 157 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 196 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 225 aa  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 269 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 269 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 265 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 248 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  32.41 
 
 		 231 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1137  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  27.73 
 
 		 220 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00330885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1208  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  27.73 
 
 		 224 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2907  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  24.22 
 
 		 188 aa  47.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.825142  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1138  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  27.73 
 
 		 222 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000112124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 249 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 269 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002288  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SlyD  26.96 
 
 		 178 aa  47.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136904  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 		 222 aa  47  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 257 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0405  methionine biosynthesis MetW  38.68 
 
 		 193 aa  47.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1395  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  24.22 
 
 		 155 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  32.74 
 
 		 242 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0508  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SlyD  25.64 
 
 		 162 aa  47  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1510  hypothetical protein  34.94 
 
 		 247 aa  46.6  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.702399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  24.24 
 
 		 235 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 259 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 285 aa  46.6  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  43.75 
 
 		 272 aa  46.6  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  55.81 
 
 		 197 aa  46.6  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  25.38 
 
 		 272 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1088  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  25.97 
 
 		 156 aa  46.6  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0776  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  23.27 
 
 		 161 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.596082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0432  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  27.42 
 
 		 141 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.09 
 
 		 258 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1473  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  22.93 
 
 		 153 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0315703  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0801  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  23.27 
 
 		 161 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320802 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2091  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  27.03 
 
 		 160 aa  46.2  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00704545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 243 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.04 
 
 		 261 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  28.02 
 
 		 259 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 241 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  25.53 
 
 		 221 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>