More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4123 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  100 
 
 
367 aa  743    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  79.29 
 
 
367 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  62.96 
 
 
370 aa  445  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  46.75 
 
 
367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  46.75 
 
 
367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  45.69 
 
 
365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  42.02 
 
 
363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  47.66 
 
 
368 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  45.04 
 
 
380 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  45.22 
 
 
356 aa  298  1e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  45.07 
 
 
381 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6661  ABC transporter related  47.91 
 
 
386 aa  295  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956463  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  45.74 
 
 
357 aa  295  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  42.51 
 
 
369 aa  295  6e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  44.44 
 
 
351 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  45.25 
 
 
357 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  44.32 
 
 
366 aa  294  2e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  47.78 
 
 
373 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  45.28 
 
 
357 aa  293  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.03 
 
 
360 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  43.66 
 
 
355 aa  293  4e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  47.74 
 
 
348 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1743  ABC-type sugar transport systems, ATPase components  47.17 
 
 
397 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0993542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  47.74 
 
 
348 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  45.3 
 
 
360 aa  292  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  45.56 
 
 
354 aa  292  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  43.68 
 
 
370 aa  292  8e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1077  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 
397 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.678355  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1654  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 
397 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0235  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 
397 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1236  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 
397 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0069  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 
397 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.284527  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0350  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 
397 aa  291  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  43.38 
 
 
355 aa  291  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  45.71 
 
 
359 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 
381 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  47.46 
 
 
348 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.35 
 
 
352 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  44.85 
 
 
359 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6133  ABC transporter related  44.16 
 
 
351 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269314  normal  0.315029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.3 
 
 
349 aa  289  6e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06937  sugar ABC transportor ATP-binding protein  43.58 
 
 
364 aa  289  7e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2238  ABC transporter related protein  40.58 
 
 
384 aa  288  8e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 
357 aa  288  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  45.43 
 
 
363 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  43.06 
 
 
352 aa  287  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.06 
 
 
363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  43.32 
 
 
384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  42.3 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1770  ABC transporter related  45.04 
 
 
405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0636101  decreased coverage  0.00357448 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  43.15 
 
 
349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  45.53 
 
 
361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  41.32 
 
 
370 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  45.71 
 
 
360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  42.63 
 
 
371 aa  286  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  42.9 
 
 
359 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.49 
 
 
367 aa  285  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  48.29 
 
 
366 aa  285  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
360 aa  285  7e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.51 
 
 
369 aa  285  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 
360 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 
360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  46.88 
 
 
369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3818  ABC transporter related  44.29 
 
 
370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  49.68 
 
 
376 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  44.89 
 
 
367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.69 
 
 
356 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  46.42 
 
 
369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1416  ABC transporter related  44.02 
 
 
347 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10901  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  44.63 
 
 
361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  41.85 
 
 
360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  41.85 
 
 
360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  44.26 
 
 
354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.85 
 
 
360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  41.85 
 
 
360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  45.43 
 
 
370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  44.35 
 
 
366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  49.68 
 
 
380 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 
369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  43.61 
 
 
356 aa  283  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.48 
 
 
356 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  44.6 
 
 
333 aa  282  6.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  45.43 
 
 
360 aa  282  7.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.41 
 
 
356 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2068  ABC transporter related  45.96 
 
 
364 aa  282  8.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  46.88 
 
 
389 aa  282  8.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  44.97 
 
 
391 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.41 
 
 
356 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  44.82 
 
 
366 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  41.55 
 
 
367 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  41.55 
 
 
367 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.73 
 
 
349 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  43.77 
 
 
366 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  43.18 
 
 
378 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  45.35 
 
 
375 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  43.1 
 
 
366 aa  281  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  41.9 
 
 
364 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.42 
 
 
356 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.39 
 
 
357 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6268  ABC transporter related  43.49 
 
 
372 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>