More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3577 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3577  ABC transporter related  100 
 
 
271 aa  540  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045338  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0175  ABC transporter related  53.12 
 
 
265 aa  261  8e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.406757  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0187  ABC transporter related protein  53.54 
 
 
265 aa  258  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0548  ABC transporter-related protein  45.2 
 
 
265 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3325  ABC transporter-related protein  45.63 
 
 
257 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946255  normal  0.977601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2772  ABC transporter related  46.28 
 
 
289 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  41.63 
 
 
265 aa  178  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  41.3 
 
 
261 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  38.71 
 
 
269 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  41.3 
 
 
261 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  41.3 
 
 
261 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  40.93 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  41.53 
 
 
280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 
263 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.8 
 
 
265 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.8 
 
 
265 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.8 
 
 
265 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  39.15 
 
 
321 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  39.57 
 
 
326 aa  171  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  39.15 
 
 
321 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  44.07 
 
 
285 aa  170  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.4 
 
 
263 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 
265 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  40 
 
 
262 aa  169  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
295 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  38.06 
 
 
279 aa  166  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.62 
 
 
264 aa  166  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  38.14 
 
 
293 aa  166  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.8 
 
 
285 aa  165  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  33.86 
 
 
259 aa  163  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  41.7 
 
 
275 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.63 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  44.63 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  39.15 
 
 
308 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1315  ABC transporter related  43.93 
 
 
267 aa  162  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  40 
 
 
268 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  43.8 
 
 
262 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.47 
 
 
251 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  37.87 
 
 
297 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  37.87 
 
 
297 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  37.87 
 
 
297 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  40.51 
 
 
262 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  41.87 
 
 
285 aa  159  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  40.73 
 
 
265 aa  159  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  37.87 
 
 
297 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  37.8 
 
 
258 aa  158  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.45 
 
 
271 aa  158  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  40.95 
 
 
324 aa  158  9e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  43.39 
 
 
262 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  39.31 
 
 
490 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  35.86 
 
 
259 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  42.44 
 
 
263 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  42.98 
 
 
257 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  41.7 
 
 
283 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  39.44 
 
 
255 aa  155  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  40.76 
 
 
270 aa  156  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  38.34 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  38.34 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.34 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  38.34 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  41.31 
 
 
263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  43.28 
 
 
263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  43.24 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  37.85 
 
 
307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3725  ABC transporter related protein  40.24 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  38.71 
 
 
260 aa  155  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.94 
 
 
255 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0869  ABC transporter related  35.46 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0846  ABC transporter related  35.46 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  31.2 
 
 
266 aa  153  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  34.9 
 
 
455 aa  152  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  40.23 
 
 
255 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  42.04 
 
 
294 aa  151  8.999999999999999e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  42.19 
 
 
254 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  43.1 
 
 
257 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  31.2 
 
 
266 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1432  ABC transporter related  34.19 
 
 
260 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.67 
 
 
253 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  40.54 
 
 
255 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  34.01 
 
 
270 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  37.78 
 
 
259 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  40.42 
 
 
267 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  38.19 
 
 
255 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  38.58 
 
 
255 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.22 
 
 
259 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  38.63 
 
 
264 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1117  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.61 
 
 
251 aa  149  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.606006  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  37.61 
 
 
262 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  38.58 
 
 
255 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  32.8 
 
 
259 aa  148  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1298  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  37.61 
 
 
251 aa  148  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0252271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  32.4 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  39.75 
 
 
254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  36.96 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  41.41 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  41.07 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  36.8 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  39.84 
 
 
255 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  42.48 
 
 
271 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>