More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0407 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0407  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 315 aa  632  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0524  extracellular solute-binding protein family 3  79.49 
 
 		 315 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2151  extracellular solute-binding protein family 3  78.77 
 
 		 326 aa  478  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2491  extracellular solute-binding protein family 3  80.14 
 
 		 327 aa  475  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2089  extracellular solute-binding protein  68.2 
 
 		 310 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2412  extracellular solute-binding protein  68.9 
 
 		 308 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0525  extracellular solute-binding protein family 3  68.44 
 
 		 305 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2490  extracellular solute-binding protein family 3  67.35 
 
 		 311 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2150  extracellular solute-binding protein family 3  66.67 
 
 		 311 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1919  extracellular solute-binding protein  64.59 
 
 		 301 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.659618  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3008  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  64.54 
 
 		 309 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2889  extracellular solute-binding protein  64.89 
 
 		 309 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00285086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2085  extracellular solute-binding protein  56.76 
 
 		 295 aa  332  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5205  ABC transporter substrate binding protein  55.35 
 
 		 312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5206  ABC transporter substrate binding protein  53.62 
 
 		 311 aa  295  9e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.35 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2504  ABC transporter substrate-binding protein  55.72 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3684  extracellular solute-binding protein family 3  51.39 
 
 		 326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  50.51 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4350  extracellular solute-binding protein  50.85 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.771986  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3901  extracellular solute-binding protein  54.62 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5877  extracellular solute-binding protein  51.35 
 
 		 317 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280922  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4349  extracellular solute-binding protein  50.17 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17246  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0397  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  51.99 
 
 		 314 aa  275  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4428  extracellular solute-binding protein  50.58 
 
 		 317 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1534  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  50.58 
 
 		 315 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.12119 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6385  extracellular solute-binding protein  49.81 
 
 		 313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3938  extracellular solute-binding protein  50.19 
 
 		 317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138287  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3860  extracellular solute-binding protein  50.58 
 
 		 317 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4320  extracellular solute-binding protein  50.19 
 
 		 317 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4191  extracellular solute-binding protein  50.38 
 
 		 347 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2408  cystine-binding periplasmic protein FliY  48.54 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1691  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.54 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0740  cystine-binding periplasmic protein FliY  48.54 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1888  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.54 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0560  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.54 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5512  extracellular solute-binding protein  49.07 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913196  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1680  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.54 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2269  cystine-binding periplasmic protein FliY  48.54 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0485236  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5876  extracellular solute-binding protein  49.07 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.266759 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0388  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.81 
 
 		 313 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  0.56756 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1701  extracellular solute-binding protein family 3  49.64 
 
 		 324 aa  266  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5566  extracellular solute-binding protein family 3  48.5 
 
 		 311 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  48.82 
 
 		 335 aa  262  4.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1894  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.97 
 
 		 397 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2401  amino acid ABC transporter periplasmic protein  47.97 
 
 		 311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22921  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1686  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.97 
 
 		 311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1687  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.97 
 
 		 311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129998  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0566  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.97 
 
 		 311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2264  cystine-binding periplasmic protein FliY  47.97 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0734  cystine-binding periplasmic protein FliY  47.97 
 
 		 406 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1530  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  47.97 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4324  extracellular solute-binding protein  47.6 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3864  extracellular solute-binding protein  47.6 
 
 		 313 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384517  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3934  twin-arginine translocation pathway signal  49.22 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0254446  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5873  extracellular solute-binding protein  49.22 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0885292 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4432  extracellular solute-binding protein  49.22 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4187  extracellular solute-binding protein  49.41 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  50.37 
 
 		 341 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2931  extracellular solute-binding protein  48.21 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4344  extracellular solute-binding protein family 3  42.35 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3708  extracellular solute-binding protein family 3  44.15 
 
 		 354 aa  203  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  39.78 
 
 		 348 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  39.86 
 
 		 331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  45.53 
 
 		 734 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3765  extracellular solute-binding protein family 3  39.63 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  30.77 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  30.91 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  29.2 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  30.68 
 
 		 313 aa  96.3  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  29.53 
 
 		 313 aa  91.7  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 302 aa  89.4  8e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  26.94 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  31.03 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  31.03 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  33.12 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  31.03 
 
 		 266 aa  79  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  31.03 
 
 		 285 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  30.6 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  30.6 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  30.6 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  30.38 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  30.17 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  30.17 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  30.17 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  28.69 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  26.84 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  26.3 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  28.28 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0407  putative ABC transporter binding protein subunit  29.31 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  30.17 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0657  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  39.5 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2113  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0691  extracellular solute-binding protein  39.5 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04090  putative binding protein component of ABC transporter  28.45 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  29.31 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  29.31 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  25.97 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>