221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1759 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1759  flagellar hook capping protein  100 
 
 
134 aa  268  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  35.34 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2038  flagellar hook capping protein  37.96 
 
 
136 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  30.43 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  34.51 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  31.58 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3552  flagellar basal body rod modification protein  36.17 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2984  flagellar hook capping protein  39.78 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  34.95 
 
 
129 aa  60.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0848  flagellar hook capping protein  27.03 
 
 
144 aa  60.8  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.538415  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0688  flagellar basal body rod modification protein  39.51 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136658  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0699  flagellar basal body rod modification protein  39.51 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608637  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  33.68 
 
 
234 aa  60.1  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0144  flagellar hook capping protein  29.52 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  31.2 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  35.71 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  32.98 
 
 
229 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  33.67 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  35.29 
 
 
221 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  46.27 
 
 
175 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2340  flagellar hook capping protein  35.34 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1702  flagellar basal body rod modification protein  34.44 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2710  flagellar hook capping protein  27.64 
 
 
275 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 
222 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  38.78 
 
 
221 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  25.78 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  33.7 
 
 
215 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0048  flagellar hook capping protein  30.69 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3102  flagellar hook capping protein  25.42 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0961418  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1502  flagellar hook capping protein  34.58 
 
 
263 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  33.7 
 
 
215 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  35.16 
 
 
184 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1567  flagellar basal body rod modification protein  27.69 
 
 
190 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1540  flagellar basal body rod modification protein  27.69 
 
 
190 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1529  flagellar basal body rod modification protein  27.69 
 
 
190 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1685  flagellar basal body rod modification protein  27.69 
 
 
190 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1750  flagellar basal body rod modification protein  27.69 
 
 
190 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0769  flagellar basal body rod modification protein  34.52 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  34.62 
 
 
242 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  37.86 
 
 
230 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  41.03 
 
 
227 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  41.03 
 
 
237 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 
277 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 
280 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  32.41 
 
 
226 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 
277 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 
277 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 
280 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 
277 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  32.63 
 
 
142 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  34.83 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  40.85 
 
 
223 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 
280 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  31.63 
 
 
235 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  34.83 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  30.97 
 
 
234 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  32.32 
 
 
233 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  33.71 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  40 
 
 
278 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  36.62 
 
 
229 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  34.52 
 
 
238 aa  53.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0752  flagellar hook capping protein  28.8 
 
 
163 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.966929  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0047  flagellar basal body rod modification protein  33.71 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1116  flagellar basal body rod modification protein  34.07 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1772  flagellar basal body rod modification protein  26.52 
 
 
192 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  37.14 
 
 
240 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3627  flagellar basal body rod modification protein  28.33 
 
 
192 aa  52  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  38.57 
 
 
248 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  39.44 
 
 
232 aa  52  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  38.57 
 
 
248 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  38.57 
 
 
248 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  35.63 
 
 
225 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1569  flagellar basal body rod modification protein  28.33 
 
 
192 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.554072  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  30.63 
 
 
225 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  35.63 
 
 
225 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31150  flagellar hook capping protein  36.59 
 
 
186 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0120404  normal  0.0821325 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  38.24 
 
 
226 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  38.57 
 
 
251 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  36.56 
 
 
225 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  37.14 
 
 
240 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1261  flagellar basal body rod modification protein  32.18 
 
 
256 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  31.51 
 
 
245 aa  51.6  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  38.57 
 
 
248 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1828  flagellar basal body rod modification protein  28.04 
 
 
192 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.122643  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  38.57 
 
 
248 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  38.57 
 
 
247 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1342  flagellar basal body rod modification protein  30.53 
 
 
270 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 
220 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  31.43 
 
 
190 aa  51.2  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0415  flagellar hook capping protein  29.17 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  36.62 
 
 
223 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  25.69 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1269  flagellar hook capping protein  29.81 
 
 
226 aa  50.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271153  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  33.8 
 
 
233 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  36.62 
 
 
221 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0567  flagellar hook capping protein  38.03 
 
 
236 aa  50.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2960  flagellar basal body rod modification protein  32.18 
 
 
256 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198197  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3098  flagellar basal body rod modification protein  32.18 
 
 
256 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1719  flagellar basal body rod modification protein  27.5 
 
 
192 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>