More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0903 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
213 aa  428  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  52.43 
 
 
205 aa  225  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  53.66 
 
 
211 aa  217  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  50.97 
 
 
205 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  51.69 
 
 
207 aa  216  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  46.83 
 
 
205 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  46.6 
 
 
210 aa  194  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  47.85 
 
 
209 aa  193  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  43.48 
 
 
207 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  47.6 
 
 
208 aa  190  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  46.41 
 
 
209 aa  190  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  47.87 
 
 
213 aa  187  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  46 
 
 
210 aa  185  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  47.62 
 
 
209 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  47.6 
 
 
251 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  42.99 
 
 
216 aa  179  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  43.2 
 
 
206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  46.41 
 
 
209 aa  175  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  43.96 
 
 
212 aa  170  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  38.57 
 
 
206 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  43.75 
 
 
207 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  42.38 
 
 
209 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  38.1 
 
 
206 aa  165  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  40.1 
 
 
201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  41.43 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  42.58 
 
 
215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  42.31 
 
 
217 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  41.83 
 
 
218 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  44.55 
 
 
214 aa  158  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  41.35 
 
 
218 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  41.78 
 
 
210 aa  157  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 
215 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  42.31 
 
 
218 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  42.51 
 
 
218 aa  156  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  40.38 
 
 
214 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  41.26 
 
 
209 aa  154  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  40.38 
 
 
213 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  40.38 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  39.15 
 
 
217 aa  152  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  40.3 
 
 
198 aa  152  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.79 
 
 
215 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.79 
 
 
215 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.79 
 
 
215 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.79 
 
 
215 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.79 
 
 
215 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  43.07 
 
 
213 aa  151  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  42.31 
 
 
215 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 
220 aa  150  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  42.44 
 
 
214 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  41.83 
 
 
215 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  41.83 
 
 
215 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  39.42 
 
 
214 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  41.83 
 
 
215 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  43.56 
 
 
211 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  41.83 
 
 
215 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  40.1 
 
 
237 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  41.83 
 
 
215 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  41.83 
 
 
215 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  41.83 
 
 
215 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  39.41 
 
 
219 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  41.83 
 
 
215 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  42.44 
 
 
212 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  39.42 
 
 
214 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  39.42 
 
 
238 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  42.36 
 
 
217 aa  149  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  42.57 
 
 
213 aa  148  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 
214 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  41.87 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  43.75 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  36.97 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  40.58 
 
 
218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  42.03 
 
 
217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  40.64 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  40.48 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  39.9 
 
 
213 aa  145  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  39.9 
 
 
222 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.58 
 
 
216 aa  145  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  39.51 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  40.1 
 
 
216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  39.9 
 
 
213 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  39.02 
 
 
214 aa  145  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  40.09 
 
 
222 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  40.09 
 
 
222 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  40.09 
 
 
222 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  42.03 
 
 
212 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  39.8 
 
 
208 aa  144  9e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  43.27 
 
 
215 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  37.21 
 
 
215 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  39.41 
 
 
222 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  39.02 
 
 
214 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  37.09 
 
 
217 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  40.85 
 
 
215 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 
215 aa  141  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  38.92 
 
 
230 aa  141  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  40 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  40.98 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  40.49 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  38.2 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  36.97 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>