More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4192 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  100 
 
 
390 aa  790    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  40.27 
 
 
410 aa  236  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  37.57 
 
 
449 aa  229  8e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  38.61 
 
 
390 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  40.24 
 
 
374 aa  224  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  36.62 
 
 
376 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  36.62 
 
 
383 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 
401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  31.5 
 
 
383 aa  179  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  34.43 
 
 
389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 
389 aa  172  9e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  33.52 
 
 
368 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  34.6 
 
 
416 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  33.52 
 
 
373 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  35.2 
 
 
392 aa  169  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  32.66 
 
 
388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  34.42 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  34.42 
 
 
397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  34.42 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  34.42 
 
 
397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  34.42 
 
 
397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  34.42 
 
 
465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 
384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  31.87 
 
 
399 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  34.07 
 
 
379 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  35.81 
 
 
404 aa  160  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  33.52 
 
 
391 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  32.42 
 
 
384 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  33.6 
 
 
378 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  33.7 
 
 
379 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  33.06 
 
 
382 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  32.25 
 
 
384 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  34.1 
 
 
346 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  32.79 
 
 
382 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  35.12 
 
 
385 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  34.21 
 
 
376 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  32.52 
 
 
361 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  34.82 
 
 
385 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  31.4 
 
 
391 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
387 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  30.37 
 
 
391 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  31.4 
 
 
373 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  31.44 
 
 
379 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  31.61 
 
 
379 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  36.4 
 
 
323 aa  144  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  31.69 
 
 
376 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  31.75 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  30.05 
 
 
391 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  30.05 
 
 
391 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  31.32 
 
 
385 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  31.18 
 
 
391 aa  139  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  31.08 
 
 
379 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  31.32 
 
 
389 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  29.92 
 
 
394 aa  136  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  31.87 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  28.49 
 
 
383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  31.27 
 
 
377 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  30.29 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4734  CBS domain-containing protein  30.67 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  31.28 
 
 
240 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  31 
 
 
325 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51100  HPP domain and CBS domain pair-containing protein  30.72 
 
 
374 aa  113  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299574  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  30.54 
 
 
366 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  36.99 
 
 
285 aa  110  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  37.5 
 
 
238 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  34.24 
 
 
324 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  35.96 
 
 
301 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  27.64 
 
 
420 aa  99.8  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  36.89 
 
 
231 aa  99.4  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  34.88 
 
 
284 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  30.24 
 
 
404 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2860  HPP  35.16 
 
 
231 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  36.36 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  27.98 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  34.1 
 
 
180 aa  74.7  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  33.96 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  43.75 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  36.31 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1922  CBS domain containing membrane protein  27.66 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  30.67 
 
 
189 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  40.83 
 
 
173 aa  72  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  33.75 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  32.26 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  28.82 
 
 
190 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  36.13 
 
 
167 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  36.61 
 
 
164 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  36 
 
 
159 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  36 
 
 
159 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  27.87 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  33.12 
 
 
176 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  29.38 
 
 
161 aa  64.7  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  34.64 
 
 
159 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  33.88 
 
 
184 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  34.25 
 
 
207 aa  63.5  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  27.01 
 
 
231 aa  63.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  30.36 
 
 
194 aa  63.5  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  37.4 
 
 
184 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  30.59 
 
 
185 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>