More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1949 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  100 
 
 		 385 aa  777    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2206  Cysteine desulfurase  64.77 
 
 		 387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0240111  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0675  aminotransferase, class V  57.55 
 
 		 385 aa  434  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00811405  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  56.36 
 
 		 382 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  50.67 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  55.04 
 
 		 373 aa  358  6e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  42.45 
 
 		 382 aa  317  3e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  46.48 
 
 		 383 aa  315  6e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  41.88 
 
 		 392 aa  315  8e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  45.83 
 
 		 383 aa  315  9e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  43.19 
 
 		 388 aa  307  3e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 384 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  42.56 
 
 		 384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  47.41 
 
 		 1143 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  42.34 
 
 		 394 aa  301  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  43.92 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  40.11 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  43.68 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  42.78 
 
 		 400 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  42.86 
 
 		 400 aa  297  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  45.22 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  42.27 
 
 		 402 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  43.67 
 
 		 403 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  43.93 
 
 		 403 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  43.93 
 
 		 436 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  43.93 
 
 		 436 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  45.14 
 
 		 1135 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  46.13 
 
 		 1139 aa  293  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  40.57 
 
 		 392 aa  293  4e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  43.92 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  41.33 
 
 		 397 aa  290  4e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  45.78 
 
 		 410 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.15 
 
 		 404 aa  288  9e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  37.6 
 
 		 382 aa  288  1e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  44.82 
 
 		 400 aa  288  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  40.78 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  43.52 
 
 		 388 aa  287  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  39.53 
 
 		 405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  41.79 
 
 		 398 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  40.67 
 
 		 407 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  39.95 
 
 		 414 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  42.08 
 
 		 398 aa  286  5e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  40.41 
 
 		 407 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  40.16 
 
 		 407 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  40.81 
 
 		 502 aa  285  7e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  42.23 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  40.41 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  40.68 
 
 		 386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  45.85 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  40.05 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  39.28 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  39.28 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  41.56 
 
 		 399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  39.79 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  40.83 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  41.62 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  40.62 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  45.09 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  45.48 
 
 		 407 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  41.49 
 
 		 405 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  40.67 
 
 		 405 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  40.41 
 
 		 407 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  40.41 
 
 		 407 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  40.41 
 
 		 407 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  40.41 
 
 		 407 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  41.3 
 
 		 389 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  41.76 
 
 		 383 aa  282  6.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  40.37 
 
 		 396 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  42.13 
 
 		 409 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  39.9 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  40.78 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  41.18 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  40.41 
 
 		 407 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  39.95 
 
 		 393 aa  280  2e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  40.41 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  40.16 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  41.56 
 
 		 399 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  39.84 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  40.16 
 
 		 407 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  40.16 
 
 		 407 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2004  aminotransferase, class V  42.53 
 
 		 399 aa  280  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0411095  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  40.41 
 
 		 407 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  40.41 
 
 		 407 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  40.41 
 
 		 407 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2368  aminotransferase, class V  42.53 
 
 		 399 aa  279  5e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0313381  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  41.43 
 
 		 404 aa  279  5e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.15 
 
 		 396 aa  279  5e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3999  cysteine desulfurase IscS  40.83 
 
 		 406 aa  279  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102036  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  39.69 
 
 		 396 aa  279  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2115  aminotransferase class V  42.53 
 
 		 399 aa  279  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.903448  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  39.12 
 
 		 398 aa  279  7e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  39.12 
 
 		 398 aa  279  7e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 383 aa  278  9e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  41.18 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  39.79 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  40.41 
 
 		 406 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  44.96 
 
 		 407 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  40.82 
 
 		 404 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  40.94 
 
 		 402 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  41.49 
 
 		 401 aa  276  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>