40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1107 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1107  hypothetical protein  100 
 
 		 591 aa  1216    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000952777  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  39.42 
 
 		 593 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  28.07 
 
 		 581 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  32.64 
 
 		 595 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  24.32 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  23.31 
 
 		 680 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.24 
 
 		 708 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  22.47 
 
 		 583 aa  60.5  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  25.17 
 
 		 602 aa  60.1  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.363979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  23.72 
 
 		 572 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  24.37 
 
 		 580 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  25.24 
 
 		 368 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  20.17 
 
 		 364 aa  50.8  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.38 
 
 		 573 aa  50.4  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1772  hypothetical protein  21.09 
 
 		 573 aa  50.4  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755026  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  21.34 
 
 		 571 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  21.61 
 
 		 382 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  25.34 
 
 		 448 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  40 
 
 		 448 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  25 
 
 		 703 aa  47  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  28.03 
 
 		 666 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  48.15 
 
 		 1156 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  24.84 
 
 		 566 aa  47  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  22.31 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0282  AAA ATPase  22.8 
 
 		 378 aa  46.2  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.11 
 
 		 603 aa  44.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  44.19 
 
 		 336 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5733  hypothetical protein  46.3 
 
 		 1156 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5978  hypothetical protein  46.3 
 
 		 1156 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.01 
 
 		 548 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  29.11 
 
 		 976 aa  44.3  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  21.53 
 
 		 382 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  21.53 
 
 		 382 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  21.6 
 
 		 565 aa  44.3  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1564  hypothetical protein  45.28 
 
 		 1155 aa  44.3  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  28.86 
 
 		 450 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1156 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1156 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1156 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.18 
 
 		 652 aa  43.5  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>