202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4783 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4783  putative metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 329 aa  656    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0983875  normal  0.561862 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1852  putative metal dependent phosphohydrolase  58.54 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3466  putative metal dependent phosphohydrolase  59.87 
 
 		 330 aa  361  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2242  putative metal dependent phosphohydrolase  59.62 
 
 		 333 aa  350  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2752  putative metal dependent phosphohydrolase  59.62 
 
 		 333 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2693  HD-GYP domain-containing protein  51.74 
 
 		 319 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1003  putative metal dependent phosphohydrolase  35.41 
 
 		 423 aa  168  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4666  putative metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4051  HD-GYP domain-containing protein  36.29 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2795  hypothetical protein  36.23 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0489  HD-GYP domain-containing protein  34.77 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2773  hypothetical protein  30.51 
 
 		 409 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.804833  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1357  metal dependent phosphohydrolase  31.6 
 
 		 399 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4311  putative metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 		 408 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2647  metal dependent phosphohydrolase  38.66 
 
 		 385 aa  109  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.427362 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0373  putative metal dependent phosphohydrolase  32.88 
 
 		 410 aa  95.9  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0258  metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  28.63 
 
 		 436 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  26.26 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  29.3 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  30.24 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0202  metal dependent phosphohydrolase  26.76 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  29.41 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0563  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  27.47 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  30.27 
 
 		 427 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  29.73 
 
 		 414 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  24.53 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1930  metal dependent phosphohydrolase  27.04 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.421896  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  26.74 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  26.34 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  27.72 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  26.63 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  25.14 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  28.42 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  27.2 
 
 		 448 aa  62.8  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  23.5 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  23.55 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  22.79 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  23.71 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  26.76 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  22.28 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  25.65 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  27.05 
 
 		 439 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  23.2 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  22.5 
 
 		 424 aa  59.3  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  25.67 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  29.19 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  27.81 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  22.64 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  26.7 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2876  metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.327621 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  24.06 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  22.38 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  23.22 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  23.61 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  26.23 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  23.53 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  25.47 
 
 		 441 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  27.11 
 
 		 403 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  21.4 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  26.63 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  23.38 
 
 		 406 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  24.61 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  24.6 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  24.66 
 
 		 391 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  22.49 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  24.6 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  25.46 
 
 		 421 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  27.07 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1227  metal dependent phosphohydrolase  24.29 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  22.45 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  26.44 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  26.46 
 
 		 403 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  25.51 
 
 		 401 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  22.97 
 
 		 421 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  25.51 
 
 		 401 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  22.97 
 
 		 420 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  22.97 
 
 		 420 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  22.97 
 
 		 420 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  23.81 
 
 		 400 aa  53.5  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  22.75 
 
 		 431 aa  53.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  25.51 
 
 		 401 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 		 402 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  25.7 
 
 		 488 aa  53.1  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2302  HD domain-containing protein  24.76 
 
 		 421 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.332838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.08 
 
 		 880 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.08 
 
 		 860 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  24.15 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1256  HD domain-containing protein  24.34 
 
 		 392 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0488462  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3863  metal dependent phosphohydrolase  29.56 
 
 		 231 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.383741 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  24.44 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  28.8 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  23.21 
 
 		 424 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  24.44 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>